47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0010 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0010  hypothetical protein  100 
 
 
513 aa  1038    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  32.55 
 
 
1188 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3256  transcriptional regulator, LuxR family  33.42 
 
 
438 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  30.06 
 
 
1193 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  30.28 
 
 
1213 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2292  ATPase  27.31 
 
 
471 aa  146  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  29.12 
 
 
1208 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4055  ATPase  28.27 
 
 
460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583039  normal  0.0382097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4702  WD-40 repeat-containing protein  30.21 
 
 
464 aa  133  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  28.06 
 
 
566 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1356  NB-ARC  32.84 
 
 
492 aa  129  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000010026  normal  0.0147503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0590  hypothetical protein  25.36 
 
 
462 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401741  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1440  WD repeat-containing protein  26.2 
 
 
464 aa  124  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  28.78 
 
 
1221 aa  120  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2114  WD repeat-containing protein  26.43 
 
 
477 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485038  normal  0.942485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  29.65 
 
 
1209 aa  109  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  28.14 
 
 
1190 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  26.58 
 
 
1188 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  29.11 
 
 
1196 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4804  response regulator receiver protein  27.12 
 
 
462 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0153583  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2788  hypothetical protein  27.07 
 
 
396 aa  99.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640991  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0639  WD repeat-containing protein  30.25 
 
 
315 aa  94  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.221679  decreased coverage  0.0018351 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  26.11 
 
 
1411 aa  86.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  30.82 
 
 
1247 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  30.39 
 
 
470 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  35.29 
 
 
638 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2808  hypothetical protein  26.83 
 
 
483 aa  57.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2810  hypothetical protein  25.83 
 
 
482 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0246562  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  26.58 
 
 
689 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  26.25 
 
 
457 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  29.5 
 
 
792 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3861  hypothetical protein  42.19 
 
 
450 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.124994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0943  serine/threonine protein kinase  32.2 
 
 
384 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  28.37 
 
 
960 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  36.23 
 
 
1043 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  41.3 
 
 
1097 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  31.15 
 
 
999 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  27.04 
 
 
630 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 
755 aa  44.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  28.75 
 
 
776 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  48.89 
 
 
1158 aa  44.3  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49839  predicted protein  25.08 
 
 
1164 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  40.74 
 
 
969 aa  43.5  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  22.73 
 
 
777 aa  43.5  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1540  AAA ATPase  39.29 
 
 
778 aa  43.5  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000740195  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  35.94 
 
 
701 aa  43.5  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  30.49 
 
 
1056 aa  43.5  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>