31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2810 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2810  hypothetical protein  100 
 
 		 482 aa  983    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0246562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2808  hypothetical protein  31.77 
 
 		 483 aa  166  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1356  NB-ARC  31.34 
 
 		 492 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000010026  normal  0.0147503 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  27.67 
 
 		 1208 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2788  hypothetical protein  32.37 
 
 		 396 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3462  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 791 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  29.76 
 
 		 1209 aa  70.5  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 1221 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  25.95 
 
 		 1213 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  28.74 
 
 		 566 aa  64.3  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3256  transcriptional regulator, LuxR family  29.67 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4702  WD-40 repeat-containing protein  24.67 
 
 		 464 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1440  WD repeat-containing protein  24.3 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  24.25 
 
 		 1188 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  26.38 
 
 		 921 aa  56.6  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3413  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 783 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0010  hypothetical protein  25.83 
 
 		 513 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  25.89 
 
 		 1190 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  24.81 
 
 		 1188 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2292  ATPase  24.8 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  22.49 
 
 		 1193 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  28.81 
 
 		 1196 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0590  hypothetical protein  26.42 
 
 		 462 aa  47.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4055  ATPase  25 
 
 		 460 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583039  normal  0.0382097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  24.02 
 
 		 632 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4804  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0153583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  24.18 
 
 		 1411 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  35.53 
 
 		 773 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0269  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 729 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 901 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  25.68 
 
 		 755 aa  43.5  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>