77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3462 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3462  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 791 aa  1635    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3413  TPR repeat-containing protein  42.26 
 
 		 783 aa  635  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  29.93 
 
 		 1208 aa  121  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2292  ATPase  24.89 
 
 		 471 aa  117  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0590  hypothetical protein  25.68 
 
 		 462 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  26.13 
 
 		 1213 aa  98.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  26.09 
 
 		 1193 aa  84.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  25.15 
 
 		 1188 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  23.69 
 
 		 1188 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2114  WD repeat-containing protein  24.73 
 
 		 477 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485038  normal  0.942485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2810  hypothetical protein  27.48 
 
 		 482 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0246562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4055  ATPase  29.21 
 
 		 460 aa  77.4  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583039  normal  0.0382097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1440  WD repeat-containing protein  25.13 
 
 		 464 aa  76.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  23.68 
 
 		 566 aa  74.3  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  28.74 
 
 		 809 aa  62.4  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  21.81 
 
 		 782 aa  61.6  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  27.41 
 
 		 1009 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  23.27 
 
 		 1003 aa  60.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  22.11 
 
 		 1033 aa  60.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1238 aa  60.1  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0735  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0940176 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  27.22 
 
 		 1190 aa  58.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1060 aa  58.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  27.75 
 
 		 775 aa  57.8  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  23.35 
 
 		 1411 aa  57.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.79 
 
 		 991 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  20.74 
 
 		 957 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  24.7 
 
 		 1209 aa  55.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 436 aa  55.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  22.41 
 
 		 1266 aa  54.3  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  36.05 
 
 		 638 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  21.67 
 
 		 689 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4804  response regulator receiver protein  22.12 
 
 		 462 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0153583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0853  ATPase  28.02 
 
 		 844 aa  53.1  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 1221 aa  52  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.03 
 
 		 1441 aa  51.6  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1907  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 575 aa  52  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3256  transcriptional regulator, LuxR family  22.77 
 
 		 438 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2664  putative PAS/PAC sensor protein  26.57 
 
 		 695 aa  51.2  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.228466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  28.7 
 
 		 1147 aa  51.2  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1793  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1149 aa  50.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  26.09 
 
 		 828 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 1025 aa  50.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  28.34 
 
 		 921 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 412 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  23.22 
 
 		 1001 aa  50.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  24.66 
 
 		 981 aa  49.3  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  31.55 
 
 		 1017 aa  48.9  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1526 aa  48.5  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  24.18 
 
 		 985 aa  48.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.87 
 
 		 636 aa  47.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  22.6 
 
 		 1017 aa  47.8  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  28.45 
 
 		 1196 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  25.23 
 
 		 1020 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6656  serine/threonine protein kinase  27.22 
 
 		 979 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.38837  normal  0.794447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1234  Tetratricopeptide TPR_4  27.86 
 
 		 832 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840453  decreased coverage  0.00091605 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 1298 aa  47.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 		 1063 aa  47.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  24.57 
 
 		 910 aa  47  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  23.51 
 
 		 838 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  25.96 
 
 		 650 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  28.1 
 
 		 741 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  25.58 
 
 		 755 aa  46.2  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  31.25 
 
 		 919 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.38 
 
 		 767 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 799 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 343 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  31.84 
 
 		 916 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.78 
 
 		 560 aa  45.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  26.73 
 
 		 490 aa  45.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  26.24 
 
 		 740 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  25 
 
 		 1071 aa  45.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1333  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.85 
 
 		 365 aa  45.1  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 1298 aa  45.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0071  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 617 aa  44.7  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0689126  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 		 1313 aa  44.7  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  32.39 
 
 		 648 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>