36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1333 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1333  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 365 aa  719    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2126  TPR domain-containing protein  25.79 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000503657  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1840  TPR domain-containing protein  25.79 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00013398  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2218  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 842 aa  50.8  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.000600865  normal  0.100568 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.89 
 
 		 293 aa  50.1  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  28.87 
 
 		 1266 aa  49.7  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.31 
 
 		 1979 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 605 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  25.35 
 
 		 1056 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 		 4079 aa  47.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 565 aa  47  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0213  TPR domain-containing protein  21.47 
 
 		 380 aa  47  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000856086  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 392 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  23.98 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  27.84 
 
 		 2145 aa  45.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3462  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 791 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.82 
 
 		 632 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1463  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951693  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 543 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 562 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 1060 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 243 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 575 aa  44.3  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.17 
 
 		 725 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 1827 aa  43.9  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.6 
 
 		 733 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.41 
 
 		 818 aa  43.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  24.12 
 
 		 267 aa  43.5  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  22.13 
 
 		 730 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  23.59 
 
 		 622 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  27.05 
 
 		 590 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 1421 aa  43.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3548  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.04 
 
 		 313 aa  42.7  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.385244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>