177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2664 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2664  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 695 aa  1416    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.228466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0071  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 617 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0689126  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1907  TPR repeat-containing protein  46 
 
 		 575 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3806  TPR repeat-containing protein  39.6 
 
 		 600 aa  97.8  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0299153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  27.11 
 
 		 782 aa  92.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1128 aa  90.1  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  26.32 
 
 		 1111 aa  88.6  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  46.58 
 
 		 1127 aa  86.7  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1238 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.69 
 
 		 609 aa  86.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2746  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.67 
 
 		 1096 aa  81.6  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  39.8 
 
 		 1177 aa  81.6  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 1298 aa  78.6  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  28.15 
 
 		 689 aa  75.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.57 
 
 		 636 aa  74.3  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.71 
 
 		 991 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  35.07 
 
 		 650 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 872 aa  70.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  27.27 
 
 		 1266 aa  70.9  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 1060 aa  70.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  22.18 
 
 		 1261 aa  69.7  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  27.16 
 
 		 957 aa  67.8  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_002950  PG1432  sensor histidine kinase  22.83 
 
 		 621 aa  67.4  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.197546 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  26.41 
 
 		 1288 aa  67  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  21.89 
 
 		 1147 aa  67.4  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.36 
 
 		 1279 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 408 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001599  GGDEF domain protein  20.9 
 
 		 637 aa  65.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.707658  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  23.97 
 
 		 941 aa  65.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1550 aa  65.1  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  28.53 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  22.11 
 
 		 755 aa  64.3  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0269  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 729 aa  63.9  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  31.88 
 
 		 490 aa  63.9  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  26.03 
 
 		 828 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.72 
 
 		 1186 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  23.73 
 
 		 1022 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.96 
 
 		 852 aa  63.9  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 1025 aa  63.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4076  histidine kinase  24.58 
 
 		 667 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249378  normal  0.142572 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  29.57 
 
 		 1507 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 1313 aa  62  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.11 
 
 		 1403 aa  62.4  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  32.17 
 
 		 2413 aa  62  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05578  hypothetical protein  26.21 
 
 		 650 aa  61.6  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  28.5 
 
 		 672 aa  61.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  26.47 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  23.14 
 
 		 985 aa  61.2  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 1526 aa  60.8  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.91 
 
 		 560 aa  60.5  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  24.38 
 
 		 775 aa  60.1  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2835  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 287 aa  60.1  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356723  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2310  diguanylate cyclase  24.51 
 
 		 718 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.27 
 
 		 767 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  25.23 
 
 		 725 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.22 
 
 		 760 aa  60.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 436 aa  60.1  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  27.84 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 		 659 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 1101 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1063 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  30.57 
 
 		 1212 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1382  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.83 
 
 		 868 aa  58.9  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126588  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 911 aa  58.9  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  30.49 
 
 		 991 aa  58.9  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.81 
 
 		 1295 aa  58.9  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 799 aa  58.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  28.97 
 
 		 2145 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  25.15 
 
 		 965 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  27.03 
 
 		 1009 aa  58.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  22.04 
 
 		 1048 aa  57.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 798 aa  58.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 1298 aa  57.4  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  31.47 
 
 		 1039 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  27.25 
 
 		 1215 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  30.62 
 
 		 311 aa  56.6  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.59 
 
 		 1162 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  25.51 
 
 		 809 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  23.78 
 
 		 999 aa  56.6  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 751 aa  55.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 1162 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0461  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.75 
 
 		 1195 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.45 
 
 		 2741 aa  55.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  25.31 
 
 		 1328 aa  55.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.67 
 
 		 1468 aa  55.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3191  diguanylate cyclase  24.46 
 
 		 646 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000281048  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0773  diguanylate cyclase  24.46 
 
 		 646 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000965334  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  27.17 
 
 		 1054 aa  54.7  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.96 
 
 		 2741 aa  54.3  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 1180 aa  54.3  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 		 1596 aa  54.3  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.14 
 
 		 568 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 568 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 443 aa  53.5  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  26.2 
 
 		 1914 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 545 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 639 aa  52.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 851 aa  52.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>