250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4077 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
1298 aa  2643    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0461  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.48 
 
 
1195 aa  202  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
1285 aa  190  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.69 
 
 
1279 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  27.19 
 
 
1238 aa  142  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 
1526 aa  112  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  24.9 
 
 
999 aa  108  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 
1063 aa  98.2  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 
1313 aa  94.7  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 
444 aa  92.4  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  25.9 
 
 
957 aa  92.4  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  22.76 
 
 
1596 aa  90.9  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 
924 aa  90.9  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
1105 aa  90.1  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.24 
 
 
636 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  27.27 
 
 
782 aa  90.1  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  30.75 
 
 
454 aa  89.4  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  23.59 
 
 
1180 aa  87  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
284 aa  83.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4363  hypothetical protein  26.87 
 
 
534 aa  83.2  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  27.86 
 
 
941 aa  82  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
799 aa  81.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 
1215 aa  80.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  28.73 
 
 
725 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  27.49 
 
 
1288 aa  79.3  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  29.55 
 
 
490 aa  77.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 
850 aa  76.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2236  hypothetical protein  25.16 
 
 
467 aa  76.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555143  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
1060 aa  76.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  24.3 
 
 
650 aa  74.7  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  30.06 
 
 
1328 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.44 
 
 
1424 aa  73.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  28.82 
 
 
1507 aa  73.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 
1714 aa  73.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1245  NB-ARC domain-containing protein  27.55 
 
 
848 aa  72.4  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
953 aa  72.4  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  26.19 
 
 
496 aa  72.4  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  28.9 
 
 
1266 aa  72  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.69 
 
 
767 aa  71.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.8 
 
 
568 aa  70.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
568 aa  70.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  23.16 
 
 
816 aa  70.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  26.05 
 
 
732 aa  69.3  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  29.03 
 
 
672 aa  69.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 
1101 aa  69.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.73 
 
 
943 aa  68.6  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.49 
 
 
1104 aa  68.6  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 
669 aa  68.6  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5145  hypothetical protein  30.07 
 
 
1689 aa  68.6  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0775613  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  24.11 
 
 
689 aa  68.2  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 
751 aa  67.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  24.66 
 
 
1227 aa  67  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  25.3 
 
 
2145 aa  67.4  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.54 
 
 
991 aa  67.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 
1958 aa  67.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3208  hypothetical protein  25.87 
 
 
689 aa  67  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.905159  normal  0.252675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  30.61 
 
 
212 aa  66.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  25.16 
 
 
1914 aa  66.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2834  hypothetical protein  40 
 
 
242 aa  65.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  27.05 
 
 
1131 aa  65.5  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  24.56 
 
 
1611 aa  65.5  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 
809 aa  65.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.92 
 
 
1295 aa  64.3  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.03 
 
 
885 aa  64.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  26.44 
 
 
765 aa  65.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  26.5 
 
 
1009 aa  63.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  23.91 
 
 
910 aa  63.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3909  hypothetical protein  26.12 
 
 
697 aa  63.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  24.22 
 
 
996 aa  63.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  28.22 
 
 
1550 aa  63.2  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0583  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 
1333 aa  62.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204849  normal  0.7877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  23.25 
 
 
888 aa  62.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  25.26 
 
 
809 aa  62  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 
1261 aa  62  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 
481 aa  62  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
911 aa  62  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 
923 aa  61.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  28.29 
 
 
822 aa  61.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 
726 aa  60.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  23.12 
 
 
901 aa  60.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.45 
 
 
771 aa  60.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
1450 aa  59.7  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  28.52 
 
 
1066 aa  59.3  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  24.08 
 
 
1050 aa  59.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  27.13 
 
 
992 aa  59.3  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.97 
 
 
787 aa  58.9  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  24.91 
 
 
1087 aa  58.9  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  25.93 
 
 
1290 aa  58.9  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  30.65 
 
 
362 aa  58.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  28.12 
 
 
919 aa  58.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 
843 aa  58.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  25.97 
 
 
1123 aa  58.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 
945 aa  58.5  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  25.25 
 
 
1104 aa  58.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  28.63 
 
 
1040 aa  57.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 
1298 aa  57.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 
436 aa  58.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 
443 aa  57.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.34 
 
 
1468 aa  57.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1444  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 
181 aa  57.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.196528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>