33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1793 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1793  hypothetical protein  100 
 
 		 1149 aa  2353    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1036  SEFIR domain protein  37.76 
 
 		 527 aa  135  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3997  SEFIR domain protein  30.54 
 
 		 293 aa  89.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565957  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.03 
 
 		 810 aa  85.1  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 878 aa  78.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2873  SEFIR domain protein  32.17 
 
 		 830 aa  73.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.205836  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1885  SEFIR domain protein  30.43 
 
 		 549 aa  70.1  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2477  hypothetical protein  31.14 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00283932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  28.98 
 
 		 1046 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1843  SEFIR domain-containing protein  27.27 
 
 		 513 aa  59.3  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1135  SEFIR domain-containing protein  28.22 
 
 		 324 aa  59.3  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.37 
 
 		 1737 aa  58.9  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0275  SEFIR domain-containing protein  30.3 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.34 
 
 		 3172 aa  57.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1857  SEFIR domain-containing protein  26.95 
 
 		 482 aa  57.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1660  sefir domain protein  25.9 
 
 		 316 aa  57  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3808  hypothetical protein  35.03 
 
 		 361 aa  57  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1816  hypothetical protein  27.44 
 
 		 398 aa  55.8  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 486 aa  52.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3462  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 791 aa  51.6  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  26.16 
 
 		 1507 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 448 aa  50.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  28 
 
 		 623 aa  50.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.63 
 
 		 632 aa  50.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1746  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 404 aa  49.3  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  21.56 
 
 		 955 aa  48.5  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  21.67 
 
 		 681 aa  48.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  18.18 
 
 		 1486 aa  48.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 		 3301 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 750 aa  47.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3413  TPR repeat-containing protein  22.4 
 
 		 783 aa  46.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.69 
 
 		 887 aa  45.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  20.33 
 
 		 832 aa  44.7  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>