219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0441 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  100 
 
 		 1010 aa  2042    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  29.15 
 
 		 1324 aa  270  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  29.04 
 
 		 1314 aa  267  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  28.91 
 
 		 849 aa  263  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  26.96 
 
 		 1309 aa  258  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  28.77 
 
 		 843 aa  248  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  27.63 
 
 		 845 aa  240  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  28.06 
 
 		 1509 aa  231  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  25.93 
 
 		 1311 aa  229  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  27.45 
 
 		 838 aa  226  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  27.69 
 
 		 1500 aa  221  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1383 aa  219  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1523 aa  211  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  27.39 
 
 		 900 aa  195  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  27.69 
 
 		 1068 aa  193  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  26.71 
 
 		 859 aa  192  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  26.76 
 
 		 829 aa  192  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  26.43 
 
 		 963 aa  188  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 911 aa  186  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  26.52 
 
 		 1056 aa  182  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  28.42 
 
 		 1000 aa  179  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1039 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  26.38 
 
 		 897 aa  173  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  24.13 
 
 		 1185 aa  168  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  25.76 
 
 		 899 aa  168  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  26.51 
 
 		 1326 aa  162  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  26.1 
 
 		 992 aa  154  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  23.57 
 
 		 1262 aa  150  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 785 aa  150  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  24.68 
 
 		 1261 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  23.54 
 
 		 1050 aa  145  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  28.87 
 
 		 934 aa  145  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  21.67 
 
 		 1288 aa  138  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 1283 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 1088 aa  126  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  22.77 
 
 		 1125 aa  125  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 1105 aa  122  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  27 
 
 		 713 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  28.57 
 
 		 793 aa  114  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  25.15 
 
 		 801 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  24.73 
 
 		 1488 aa  107  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  30.22 
 
 		 675 aa  107  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 		 924 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  22.18 
 
 		 1146 aa  99.4  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  27.34 
 
 		 828 aa  99  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.22 
 
 		 767 aa  98.6  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 1215 aa  97.8  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 284 aa  97.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  20.54 
 
 		 857 aa  95.1  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 		 444 aa  94  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.38 
 
 		 991 aa  94.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 837 aa  93.6  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 		 454 aa  90.5  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 568 aa  90.9  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.09 
 
 		 568 aa  90.9  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.86 
 
 		 1424 aa  90.1  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 949 aa  87.8  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  26.47 
 
 		 1131 aa  86.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.15 
 
 		 1186 aa  86.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  25.48 
 
 		 1128 aa  85.1  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  26.78 
 
 		 672 aa  85.1  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 		 481 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.48 
 
 		 1328 aa  82.4  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.88 
 
 		 787 aa  80.5  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 843 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.59 
 
 		 771 aa  79.7  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  25.95 
 
 		 799 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  27.78 
 
 		 680 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  21.14 
 
 		 822 aa  79.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  32.75 
 
 		 1507 aa  78.2  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  29 
 
 		 919 aa  78.2  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 		 751 aa  77.4  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  24.07 
 
 		 385 aa  77.4  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  24.02 
 
 		 725 aa  76.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 		 776 aa  77  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 953 aa  75.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  29.49 
 
 		 577 aa  74.3  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  21.74 
 
 		 1040 aa  74.3  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  37.07 
 
 		 373 aa  74.3  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 		 814 aa  73.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.21 
 
 		 968 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.27 
 
 		 885 aa  72.8  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  28.38 
 
 		 702 aa  72  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 966 aa  72  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  25.38 
 
 		 1475 aa  71.6  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  30.86 
 
 		 908 aa  70.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  29.57 
 
 		 1228 aa  70.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  29.02 
 
 		 958 aa  70.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  28.74 
 
 		 212 aa  70.1  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  31.77 
 
 		 913 aa  70.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  19.88 
 
 		 1550 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  24.27 
 
 		 825 aa  69.7  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  23.67 
 
 		 732 aa  68.6  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  25.35 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06955  conserved hypothetical protein  25.74 
 
 		 526 aa  67.8  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  31.64 
 
 		 190 aa  67.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.73 
 
 		 841 aa  67.4  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 		 162 aa  66.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  26.02 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  32.47 
 
 		 989 aa  64.7  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>