More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0446 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  49.03 
 
 		 771 aa  650    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 885 aa  1789    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.01 
 
 		 787 aa  610  1e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  51.52 
 
 		 1328 aa  596  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  50.08 
 
 		 1215 aa  548  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  42.72 
 
 		 1507 aa  545  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.08 
 
 		 1424 aa  511  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  32.23 
 
 		 2145 aa  421  1e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  39.47 
 
 		 799 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  41.28 
 
 		 1105 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  52.72 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.53 
 
 		 1186 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  46.79 
 
 		 924 aa  359  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  32.21 
 
 		 1050 aa  350  5e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  49.6 
 
 		 767 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  38.64 
 
 		 725 aa  346  1e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  41.89 
 
 		 1039 aa  345  2.9999999999999997e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  38.25 
 
 		 1044 aa  342  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  37.18 
 
 		 1288 aa  328  3e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  51.67 
 
 		 911 aa  325  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  28.68 
 
 		 1040 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  49.38 
 
 		 568 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  49.38 
 
 		 568 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  48.53 
 
 		 444 aa  299  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  49.53 
 
 		 843 aa  290  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  48.18 
 
 		 825 aa  287  7e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  34.33 
 
 		 1488 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.89 
 
 		 991 aa  275  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  32.54 
 
 		 1262 aa  269  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  45.35 
 
 		 919 aa  259  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  44.86 
 
 		 751 aa  258  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  46.3 
 
 		 362 aa  257  6e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  31.67 
 
 		 1185 aa  253  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  31.9 
 
 		 1550 aa  248  4e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  35.18 
 
 		 1128 aa  245  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 953 aa  243  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  37.93 
 
 		 822 aa  243  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  53.53 
 
 		 311 aa  239  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  40.16 
 
 		 493 aa  237  7e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  48.26 
 
 		 672 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  49.61 
 
 		 284 aa  229  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 		 443 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  40.53 
 
 		 977 aa  221  6e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  39.27 
 
 		 814 aa  215  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  35.6 
 
 		 1290 aa  214  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  35.15 
 
 		 1131 aa  213  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  44.69 
 
 		 680 aa  211  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  51.88 
 
 		 785 aa  207  6e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  26.77 
 
 		 732 aa  207  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  26.65 
 
 		 740 aa  204  4e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.99 
 
 		 667 aa  203  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  55.05 
 
 		 212 aa  203  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  47.01 
 
 		 481 aa  202  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 		 669 aa  198  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 1283 aa  197  9e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  33.96 
 
 		 1125 aa  196  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  37.34 
 
 		 1028 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1404 aa  191  5.999999999999999e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  32.81 
 
 		 1056 aa  189  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  27.14 
 
 		 828 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  29.42 
 
 		 919 aa  180  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  28.54 
 
 		 1088 aa  174  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  25.09 
 
 		 694 aa  173  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  54.19 
 
 		 190 aa  173  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 949 aa  167  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  25.97 
 
 		 782 aa  166  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  30.79 
 
 		 966 aa  160  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  29.53 
 
 		 1475 aa  156  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1068 aa  154  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.77 
 
 		 968 aa  152  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  24.01 
 
 		 2327 aa  152  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  25.26 
 
 		 708 aa  150  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 469 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  32.62 
 
 		 1228 aa  149  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 837 aa  146  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1054 aa  143  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 1313 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 857 aa  142  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 776 aa  141  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  33.98 
 
 		 1212 aa  141  3.9999999999999997e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  29.17 
 
 		 1106 aa  141  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.3 
 
 		 854 aa  141  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  27.02 
 
 		 686 aa  140  8.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  35.89 
 
 		 304 aa  140  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  33.87 
 
 		 963 aa  138  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 878 aa  138  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 649 aa  137  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  31.66 
 
 		 577 aa  135  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  29.95 
 
 		 1136 aa  135  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  24.92 
 
 		 1468 aa  134  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  30.93 
 
 		 1146 aa  130  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 937 aa  130  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  24.83 
 
 		 836 aa  129  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.88 
 
 		 810 aa  128  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  38.55 
 
 		 2413 aa  128  5e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  34.4 
 
 		 801 aa  124  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1238 aa  121  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  24.94 
 
 		 1261 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.33 
 
 		 1036 aa  120  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  40.51 
 
 		 162 aa  119  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>