More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3775 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 937 aa  1911    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 1054 aa  513  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 1365 aa  417  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 1409 aa  411  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 851 aa  305  3.0000000000000004e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 1215 aa  301  3e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  28.05 
 
 		 1328 aa  290  7e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.81 
 
 		 1186 aa  270  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  28.54 
 
 		 919 aa  269  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.58 
 
 		 968 aa  261  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  24.01 
 
 		 1507 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  39.73 
 
 		 1475 aa  157  7e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.09 
 
 		 767 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  33.81 
 
 		 843 aa  150  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  31.77 
 
 		 1039 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  29.43 
 
 		 1044 aa  150  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 454 aa  150  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.51 
 
 		 771 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  31.69 
 
 		 725 aa  148  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.34 
 
 		 568 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 		 568 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  31.39 
 
 		 799 aa  139  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 1105 aa  138  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  31.25 
 
 		 672 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.03 
 
 		 991 aa  132  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.22 
 
 		 1162 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 1162 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 		 911 aa  128  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.84 
 
 		 787 aa  128  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  33.09 
 
 		 825 aa  128  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 751 aa  127  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 444 aa  127  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.48 
 
 		 2741 aa  124  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  35.37 
 
 		 311 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.94 
 
 		 2741 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 284 aa  123  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  33.06 
 
 		 680 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.91 
 
 		 885 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 953 aa  120  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 481 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.17 
 
 		 1424 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  32.09 
 
 		 977 aa  117  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 924 aa  116  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  26.39 
 
 		 822 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  28.84 
 
 		 1131 aa  115  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  29.67 
 
 		 919 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  28.92 
 
 		 2145 aa  114  7.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 443 aa  110  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  29.28 
 
 		 732 aa  109  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.33 
 
 		 1060 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  30.96 
 
 		 717 aa  108  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  25.28 
 
 		 1262 aa  107  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1550 aa  107  9e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  35.39 
 
 		 190 aa  107  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 1288 aa  106  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  29.84 
 
 		 493 aa  106  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  29.34 
 
 		 362 aa  106  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 916 aa  105  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 729 aa  105  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.88 
 
 		 991 aa  105  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 854 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 669 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  33.93 
 
 		 212 aa  100  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1404 aa  98.6  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  26.83 
 
 		 532 aa  98.6  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 785 aa  97.4  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 		 966 aa  97.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 949 aa  95.5  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 1025 aa  95.1  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  23.19 
 
 		 1185 aa  94.7  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  26.74 
 
 		 1290 aa  94.4  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 857 aa  94.4  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  23.36 
 
 		 1050 aa  94  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  26.49 
 
 		 1106 aa  92  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  32.79 
 
 		 1009 aa  91.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  25.74 
 
 		 1040 aa  91.3  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 		 814 aa  88.6  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  24.15 
 
 		 1128 aa  87.8  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 1088 aa  86.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  25.1 
 
 		 1488 aa  85.1  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  27.36 
 
 		 884 aa  85.1  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3313  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000795793  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  25.66 
 
 		 1125 aa  83.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.96 
 
 		 854 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 		 162 aa  82.4  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1212 aa  82  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  23.05 
 
 		 740 aa  82  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  28.3 
 
 		 989 aa  81.3  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.82 
 
 		 854 aa  80.5  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 846 aa  80.1  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  31.06 
 
 		 828 aa  79  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  31.85 
 
 		 1246 aa  78.2  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  23.49 
 
 		 694 aa  78.2  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  22.73 
 
 		 577 aa  77.8  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.26 
 
 		 667 aa  77  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  29.91 
 
 		 418 aa  76.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 868 aa  75.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  25.85 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  28.18 
 
 		 893 aa  75.1  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>