More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0238 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 787 aa  1602    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.12 
 
 		 771 aa  747    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  51.71 
 
 		 1328 aa  615  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.38 
 
 		 885 aa  600  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  50.08 
 
 		 1215 aa  559  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  43.43 
 
 		 1507 aa  548  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50 
 
 		 1424 aa  526  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  54.15 
 
 		 454 aa  432  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  42.11 
 
 		 1105 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  49.16 
 
 		 924 aa  389  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  38.41 
 
 		 799 aa  385  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  39.7 
 
 		 1044 aa  378  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  39.82 
 
 		 725 aa  379  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  31.08 
 
 		 2145 aa  369  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  44.3 
 
 		 1039 aa  366  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.7 
 
 		 1186 aa  361  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  50.52 
 
 		 911 aa  347  7e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  37.24 
 
 		 1288 aa  345  1e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.3 
 
 		 767 aa  346  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  31.52 
 
 		 1050 aa  340  7e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  51.84 
 
 		 568 aa  310  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  51.84 
 
 		 568 aa  310  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  50.58 
 
 		 444 aa  308  3e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.58 
 
 		 991 aa  298  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  29.54 
 
 		 1040 aa  293  9e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  32.75 
 
 		 1488 aa  280  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  42.24 
 
 		 843 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  50.51 
 
 		 362 aa  273  9e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  47.04 
 
 		 919 aa  272  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  30.67 
 
 		 1262 aa  271  5e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  46.22 
 
 		 825 aa  267  5e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  54.15 
 
 		 751 aa  258  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  37.31 
 
 		 822 aa  250  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  30.62 
 
 		 1185 aa  249  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  39.88 
 
 		 1131 aa  246  9.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1550 aa  243  9e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  35.25 
 
 		 953 aa  243  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  32.35 
 
 		 1128 aa  236  9e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  47.04 
 
 		 284 aa  236  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  37.47 
 
 		 493 aa  235  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  38.75 
 
 		 443 aa  233  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  52.12 
 
 		 311 aa  231  4e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  50.21 
 
 		 672 aa  229  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  51.01 
 
 		 785 aa  213  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  40.32 
 
 		 814 aa  212  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  28.43 
 
 		 694 aa  212  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 		 1290 aa  211  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  54 
 
 		 212 aa  210  9e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  30.14 
 
 		 732 aa  206  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  39.76 
 
 		 669 aa  205  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  42.01 
 
 		 977 aa  205  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  42.62 
 
 		 680 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  50.23 
 
 		 481 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.76 
 
 		 667 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  55.25 
 
 		 190 aa  198  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  30.55 
 
 		 1056 aa  197  5.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  37.56 
 
 		 1028 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1283 aa  189  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 1088 aa  185  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1404 aa  182  2e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 949 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  31.01 
 
 		 1125 aa  177  5e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  28.4 
 
 		 1475 aa  177  9e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  32.4 
 
 		 919 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 		 966 aa  175  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  26.05 
 
 		 828 aa  169  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 776 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 469 aa  162  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  27.58 
 
 		 708 aa  161  5e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 1313 aa  160  8e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1068 aa  158  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  26.48 
 
 		 740 aa  153  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.84 
 
 		 968 aa  151  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 857 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  33.98 
 
 		 1212 aa  147  6e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  26.02 
 
 		 782 aa  147  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  34.42 
 
 		 963 aa  145  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  25.91 
 
 		 836 aa  144  6e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 		 837 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 1596 aa  139  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  23.96 
 
 		 2327 aa  137  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 649 aa  137  6.0000000000000005e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  36.68 
 
 		 304 aa  137  9e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  27.15 
 
 		 686 aa  137  9e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  30.04 
 
 		 577 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  29.61 
 
 		 1136 aa  136  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  29.88 
 
 		 1228 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1238 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.48 
 
 		 854 aa  128  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 1054 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  28.84 
 
 		 937 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  30.51 
 
 		 1106 aa  125  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  25.11 
 
 		 1468 aa  120  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  28.36 
 
 		 1914 aa  120  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  28.61 
 
 		 1146 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.04 
 
 		 810 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  27.14 
 
 		 1429 aa  118  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5235  predicted protein  34.32 
 
 		 236 aa  117  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.929624  normal  0.933998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  31.71 
 
 		 801 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 1365 aa  114  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>