249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1855 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 667 aa  1345    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  39.69 
 
 		 669 aa  365  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  38.19 
 
 		 454 aa  225  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.99 
 
 		 885 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  35.69 
 
 		 1215 aa  199  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.76 
 
 		 787 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  34.22 
 
 		 1328 aa  197  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.26 
 
 		 771 aa  194  5e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.43 
 
 		 1424 aa  187  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  32.8 
 
 		 1039 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.78 
 
 		 767 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  36.6 
 
 		 911 aa  177  7e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  36 
 
 		 825 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  38.15 
 
 		 444 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 568 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.48 
 
 		 568 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.95 
 
 		 1186 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 		 1507 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  30.7 
 
 		 1288 aa  162  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  30.62 
 
 		 1105 aa  160  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 924 aa  160  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 443 aa  158  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  28.53 
 
 		 725 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  39.83 
 
 		 751 aa  154  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  31.96 
 
 		 1131 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.47 
 
 		 991 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  34.84 
 
 		 362 aa  151  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 843 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  25.07 
 
 		 2145 aa  144  6e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  41.45 
 
 		 212 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  29.54 
 
 		 1044 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  35.86 
 
 		 311 aa  140  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  28.45 
 
 		 493 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  34.38 
 
 		 672 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  34.24 
 
 		 284 aa  135  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  26.29 
 
 		 822 aa  134  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 190 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  28.1 
 
 		 799 aa  128  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  31.79 
 
 		 919 aa  128  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 953 aa  127  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  32.65 
 
 		 680 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  29.3 
 
 		 782 aa  126  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 481 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  31.08 
 
 		 977 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  31.27 
 
 		 814 aa  121  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  27 
 
 		 694 aa  121  4.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 		 785 aa  119  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1550 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 966 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  23.74 
 
 		 740 aa  116  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  24.66 
 
 		 1050 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  33.06 
 
 		 732 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 1290 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  28.43 
 
 		 686 aa  110  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 1313 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  24.26 
 
 		 1488 aa  106  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 949 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  28.44 
 
 		 1056 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  24.31 
 
 		 836 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  25.99 
 
 		 1040 aa  104  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  28.48 
 
 		 919 aa  103  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  24.08 
 
 		 1262 aa  102  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1404 aa  101  6e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1238 aa  98.6  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.83 
 
 		 854 aa  96.3  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 1028 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 1101 aa  96.3  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  23.29 
 
 		 1128 aa  94.7  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  26.79 
 
 		 1475 aa  94.7  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  22.72 
 
 		 708 aa  92  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  24.65 
 
 		 828 aa  91.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  26.02 
 
 		 1106 aa  90.9  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  23.12 
 
 		 1185 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  23.64 
 
 		 2327 aa  88.6  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1212 aa  87.4  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  29.25 
 
 		 1914 aa  87.4  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43024  predicted protein  24.22 
 
 		 576 aa  85.1  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000321984  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 1054 aa  85.5  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 1526 aa  84.7  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 991 aa  84.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 857 aa  84.3  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 1283 aa  83.2  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  24.43 
 
 		 1009 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.1 
 
 		 1036 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  27.46 
 
 		 1479 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 162 aa  81.6  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  28.78 
 
 		 801 aa  81.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  25.69 
 
 		 807 aa  80.1  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  25.32 
 
 		 2413 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  21.73 
 
 		 833 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 1060 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  26.48 
 
 		 1596 aa  77.4  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5157  hypothetical protein  28.26 
 
 		 178 aa  77  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208303  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 937 aa  77  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 469 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 		 1088 aa  76.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 1714 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.34 
 
 		 968 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  24.32 
 
 		 937 aa  73.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  24.9 
 
 		 1228 aa  73.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>