More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3233 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
1290 aa  2534    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5384  serine/threonine protein kinase  33.27 
 
 
1109 aa  436  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00425552  normal  0.786393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  35.56 
 
 
1036 aa  417  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6656  serine/threonine protein kinase  32.85 
 
 
979 aa  350  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.38837  normal  0.794447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4130  serine/threonine protein kinase  39.76 
 
 
1005 aa  321  5e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0127288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1504  serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 
1057 aa  309  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5349  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.34 
 
 
1016 aa  305  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.553326  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1157  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.57 
 
 
1007 aa  305  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5601  serine/threonine protein kinase  31.46 
 
 
900 aa  301  7e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4122  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.49 
 
 
1126 aa  290  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289873  decreased coverage  0.00939921 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6223  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.69 
 
 
994 aa  287  7e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1260  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.33 
 
 
1024 aa  272  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.822477 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 
1105 aa  268  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6560  serine/threonine protein kinase  33.91 
 
 
847 aa  266  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139307  normal  0.187862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  36.87 
 
 
1328 aa  264  8.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.29 
 
 
1424 aa  261  9e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  35.36 
 
 
1215 aa  258  6e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 
924 aa  238  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.58 
 
 
771 aa  227  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  27.78 
 
 
1040 aa  226  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  28.4 
 
 
2145 aa  223  1.9999999999999999e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.18 
 
 
1186 aa  222  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 
454 aa  220  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  31.68 
 
 
1507 aa  219  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  30.71 
 
 
1039 aa  218  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.09 
 
 
787 aa  211  6e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4294  serine/threonine protein kinase  38.58 
 
 
536 aa  211  7e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203828  normal  0.230972 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  29.13 
 
 
1288 aa  208  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  31.19 
 
 
725 aa  206  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.64 
 
 
767 aa  204  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.6 
 
 
885 aa  201  5e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0547  serine/threonine protein kinase  39.55 
 
 
678 aa  201  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4099  serine/threonine protein kinase  28.77 
 
 
1339 aa  199  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0326022 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.33 
 
 
568 aa  198  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 
568 aa  198  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  36.83 
 
 
911 aa  194  9e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5581  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.33 
 
 
1040 aa  192  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  26.61 
 
 
1050 aa  191  9e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  37.85 
 
 
444 aa  185  4.0000000000000006e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  27.39 
 
 
1488 aa  185  6e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  36.28 
 
 
825 aa  183  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  28.5 
 
 
1550 aa  183  2e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.1 
 
 
991 aa  182  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  28.66 
 
 
799 aa  181  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 
443 aa  181  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  33.06 
 
 
1131 aa  179  5e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  25.61 
 
 
1262 aa  175  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  39.93 
 
 
814 aa  175  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  43.7 
 
 
284 aa  174  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 
843 aa  174  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4878  serine/threonine protein kinase  37.42 
 
 
622 aa  171  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160783  normal  0.181716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  30.5 
 
 
1044 aa  171  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
953 aa  169  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1322  serine/threonine protein kinase  29.1 
 
 
1003 aa  167  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  28.79 
 
 
1128 aa  166  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  34.8 
 
 
362 aa  164  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  33.74 
 
 
751 aa  161  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  26.64 
 
 
1185 aa  160  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  28.03 
 
 
822 aa  158  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  30.19 
 
 
1068 aa  158  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  27.5 
 
 
708 aa  157  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1732  serine/threonine protein kinase  44.12 
 
 
1065 aa  156  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.893925  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  36.24 
 
 
919 aa  157  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 
837 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  31.28 
 
 
493 aa  155  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  33.57 
 
 
825 aa  153  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  27.47 
 
 
1404 aa  153  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 
1088 aa  153  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 
1028 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  28.85 
 
 
694 aa  150  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6760  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.55 
 
 
815 aa  150  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  31.68 
 
 
455 aa  148  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.87 
 
 
757 aa  146  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  32.22 
 
 
919 aa  146  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  35.96 
 
 
672 aa  145  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  37.45 
 
 
493 aa  145  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  35.38 
 
 
646 aa  145  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  32.51 
 
 
1056 aa  143  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  28.46 
 
 
732 aa  142  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  35.11 
 
 
891 aa  142  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  30.75 
 
 
938 aa  141  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  26.71 
 
 
740 aa  140  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 
468 aa  140  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.97 
 
 
579 aa  140  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  31.07 
 
 
621 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.92 
 
 
1655 aa  139  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  36.55 
 
 
311 aa  138  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  31.02 
 
 
894 aa  138  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 
949 aa  139  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.92 
 
 
1398 aa  138  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  37.98 
 
 
672 aa  138  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.32 
 
 
650 aa  137  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  27.91 
 
 
666 aa  137  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  34.98 
 
 
487 aa  137  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.68 
 
 
916 aa  137  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.98 
 
 
822 aa  137  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  35.43 
 
 
680 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 
1020 aa  137  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.03 
 
 
715 aa  137  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  32.71 
 
 
862 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>