More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1169 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
444 aa  884    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  66.08 
 
 
911 aa  432  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  56.57 
 
 
454 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  55.46 
 
 
1328 aa  363  3e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  52.14 
 
 
924 aa  356  5e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  49.86 
 
 
1105 aa  338  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  48.48 
 
 
1215 aa  333  3e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  48.75 
 
 
1507 aa  332  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.14 
 
 
767 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  49.19 
 
 
771 aa  323  4e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  53.43 
 
 
1424 aa  317  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  54.85 
 
 
568 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.85 
 
 
568 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.86 
 
 
787 aa  311  1e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  48.14 
 
 
725 aa  309  5e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  47.55 
 
 
1039 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  47.93 
 
 
843 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.1 
 
 
885 aa  290  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  48.17 
 
 
825 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  53.14 
 
 
751 aa  276  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.2 
 
 
991 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.6 
 
 
1186 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  54.65 
 
 
284 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  41.16 
 
 
1044 aa  265  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  46.13 
 
 
919 aa  260  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  44.19 
 
 
362 aa  252  9.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  61.7 
 
 
785 aa  252  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  39.43 
 
 
1288 aa  249  8e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  49.42 
 
 
672 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  40.06 
 
 
1131 aa  239  5e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  47 
 
 
311 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  40.23 
 
 
953 aa  237  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  40.82 
 
 
799 aa  236  6e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  49.42 
 
 
680 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  42.43 
 
 
977 aa  226  5.0000000000000005e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  41.25 
 
 
814 aa  220  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  40.9 
 
 
443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  43.48 
 
 
1028 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  51.6 
 
 
481 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  37.46 
 
 
822 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  34.81 
 
 
1050 aa  210  5e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  53.03 
 
 
212 aa  206  7e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  33.96 
 
 
2145 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  32.2 
 
 
1488 aa  196  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  34.32 
 
 
1185 aa  196  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  35.59 
 
 
493 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  33.53 
 
 
1262 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  33.76 
 
 
1550 aa  190  5e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  35.37 
 
 
732 aa  189  8e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  35.65 
 
 
1125 aa  187  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
1290 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 
776 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  34.81 
 
 
1040 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 
1088 aa  180  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  30.22 
 
 
828 aa  180  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 
669 aa  180  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  50.81 
 
 
190 aa  178  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  34.96 
 
 
1128 aa  178  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 
949 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 
837 aa  172  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  33.53 
 
 
919 aa  169  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  34.17 
 
 
1068 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.15 
 
 
667 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  34.81 
 
 
577 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  31.64 
 
 
1106 aa  158  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 
469 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  28.74 
 
 
1475 aa  157  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  27.6 
 
 
1404 aa  156  7e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.51 
 
 
854 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  37.13 
 
 
963 aa  153  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  30.77 
 
 
694 aa  153  5e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  35.4 
 
 
686 aa  152  8e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  34.02 
 
 
1238 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  31.8 
 
 
857 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  32.73 
 
 
1212 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  28.33 
 
 
708 aa  141  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
966 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.47 
 
 
968 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 
1283 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  32.37 
 
 
1056 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  25.94 
 
 
740 aa  130  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
937 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  37.06 
 
 
1123 aa  126  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.878105 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  38.46 
 
 
304 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  46.85 
 
 
162 aa  124  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5157  hypothetical protein  41.4 
 
 
178 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208303  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 
681 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1510  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 
303 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0607189 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  29.29 
 
 
1136 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  29.76 
 
 
1324 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  24.39 
 
 
1180 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  33.76 
 
 
505 aa  117  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  32.69 
 
 
1228 aa  117  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 
1054 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 
1526 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  33.21 
 
 
801 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  29 
 
 
1146 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 
1596 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 
878 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 
1479 aa  114  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>