More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3695 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 1475 aa  3005    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  30.29 
 
 		 1328 aa  430  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 1215 aa  423  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  31.02 
 
 		 919 aa  346  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.35 
 
 		 1186 aa  298  7e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  25.42 
 
 		 1507 aa  288  5.999999999999999e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.03 
 
 		 968 aa  253  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 1105 aa  237  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 1054 aa  229  4e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  28.93 
 
 		 1288 aa  216  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.1 
 
 		 1424 aa  213  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 1050 aa  209  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 924 aa  201  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  27.81 
 
 		 1262 aa  198  6e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  34.63 
 
 		 843 aa  185  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.25 
 
 		 771 aa  184  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.2 
 
 		 568 aa  183  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 767 aa  183  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  35.2 
 
 		 568 aa  183  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  32.17 
 
 		 725 aa  180  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  27.79 
 
 		 1488 aa  179  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 454 aa  178  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  29.23 
 
 		 1185 aa  177  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.4 
 
 		 787 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 1409 aa  173  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  31.04 
 
 		 1131 aa  172  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  29.83 
 
 		 1128 aa  171  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 851 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  28.87 
 
 		 1044 aa  164  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  29.38 
 
 		 1068 aa  162  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 		 911 aa  162  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  29.7 
 
 		 1039 aa  161  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  28.61 
 
 		 828 aa  160  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  39.92 
 
 		 284 aa  157  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  39.73 
 
 		 937 aa  157  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.53 
 
 		 885 aa  155  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  37.35 
 
 		 751 aa  153  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  38.08 
 
 		 672 aa  152  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  26.94 
 
 		 799 aa  150  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33 
 
 		 991 aa  149  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  23.96 
 
 		 1040 aa  148  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 444 aa  147  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  35.83 
 
 		 680 aa  142  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  31.11 
 
 		 1056 aa  141  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 1283 aa  138  8e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 837 aa  136  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  26.22 
 
 		 822 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 		 814 aa  133  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 481 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  36.94 
 
 		 1365 aa  133  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  30.21 
 
 		 1125 aa  131  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 953 aa  131  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  35.19 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 776 aa  131  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  30 
 
 		 825 aa  129  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  33.6 
 
 		 977 aa  128  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  27.68 
 
 		 919 aa  126  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  26.71 
 
 		 362 aa  126  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 		 1290 aa  125  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  36.9 
 
 		 212 aa  121  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.54 
 
 		 2145 aa  120  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  29.38 
 
 		 1500 aa  119  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 		 190 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.72 
 
 		 1162 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 		 1162 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 469 aa  113  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  37.9 
 
 		 785 aa  114  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  29.28 
 
 		 577 aa  111  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  28.45 
 
 		 1324 aa  111  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  27.51 
 
 		 963 aa  110  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  24.15 
 
 		 694 aa  110  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  29.04 
 
 		 899 aa  108  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  38.96 
 
 		 961 aa  108  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 729 aa  106  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 443 aa  105  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  22.85 
 
 		 949 aa  103  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 966 aa  103  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  44.8 
 
 		 1402 aa  102  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  40.14 
 
 		 789 aa  102  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  41.96 
 
 		 684 aa  102  6e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  27.98 
 
 		 1146 aa  102  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 1088 aa  102  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  27.7 
 
 		 1314 aa  101  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  33.96 
 
 		 304 aa  100  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.81 
 
 		 841 aa  100  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  26.2 
 
 		 686 aa  99.8  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  32.85 
 
 		 801 aa  99.8  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  24.33 
 
 		 857 aa  99  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  46.61 
 
 		 185 aa  98.6  8e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  39.26 
 
 		 717 aa  98.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 669 aa  97.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  42.86 
 
 		 831 aa  97.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.27 
 
 		 318 aa  96.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  37.66 
 
 		 393 aa  95.1  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  22.85 
 
 		 740 aa  94.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  25.64 
 
 		 849 aa  94.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.79 
 
 		 667 aa  94.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  23.57 
 
 		 1550 aa  93.6  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  37.75 
 
 		 1493 aa  94  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  22.76 
 
 		 1468 aa  93.2  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>