More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2003 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 
831 aa  1667    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  63.41 
 
 
684 aa  632  1e-180  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  47.56 
 
 
1402 aa  556  1e-157  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  52.46 
 
 
961 aa  538  1e-151  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  55.03 
 
 
557 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  48.27 
 
 
1493 aa  508  9.999999999999999e-143  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  54.56 
 
 
789 aa  496  1e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  46.58 
 
 
685 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  53.99 
 
 
489 aa  444  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  52.49 
 
 
490 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  52.49 
 
 
490 aa  439  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  44.87 
 
 
1032 aa  422  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  54.25 
 
 
425 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  51.79 
 
 
448 aa  385  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  58.61 
 
 
393 aa  382  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  41.09 
 
 
1037 aa  374  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  39.93 
 
 
976 aa  375  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  42.39 
 
 
1877 aa  371  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.8 
 
 
528 aa  326  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  38.5 
 
 
680 aa  313  9e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  42.56 
 
 
464 aa  308  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  53.04 
 
 
341 aa  302  2e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  38.39 
 
 
679 aa  300  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  41.59 
 
 
509 aa  299  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.83 
 
 
865 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  42.54 
 
 
509 aa  297  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  41.59 
 
 
509 aa  296  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  42.54 
 
 
509 aa  296  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  52.32 
 
 
380 aa  293  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.06 
 
 
380 aa  289  1e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  41.92 
 
 
380 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  47.93 
 
 
342 aa  267  5e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  51.36 
 
 
318 aa  267  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  48.87 
 
 
1002 aa  265  3e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  49.32 
 
 
343 aa  263  8e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  29.6 
 
 
693 aa  263  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  46.2 
 
 
376 aa  261  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  47.81 
 
 
305 aa  260  8e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  45.89 
 
 
376 aa  259  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  59.82 
 
 
2413 aa  255  2.0000000000000002e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.41 
 
 
392 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  48.83 
 
 
416 aa  254  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  57.02 
 
 
256 aa  251  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  39.31 
 
 
505 aa  250  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  44.66 
 
 
359 aa  249  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  31.76 
 
 
985 aa  247  6e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  37.01 
 
 
1430 aa  244  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  31.76 
 
 
961 aa  244  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  52.61 
 
 
303 aa  243  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  53.07 
 
 
267 aa  241  2.9999999999999997e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.03 
 
 
325 aa  239  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  44.03 
 
 
325 aa  239  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  51.06 
 
 
271 aa  238  5.0000000000000005e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  44.04 
 
 
373 aa  237  8e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  38.37 
 
 
523 aa  236  9e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  43.39 
 
 
325 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  43.43 
 
 
331 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  43.71 
 
 
373 aa  234  6e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.87 
 
 
798 aa  234  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  43 
 
 
327 aa  233  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.79 
 
 
346 aa  233  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  47.08 
 
 
552 aa  231  4e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.51 
 
 
487 aa  230  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  42.86 
 
 
399 aa  229  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  49.46 
 
 
329 aa  228  3e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  32.19 
 
 
591 aa  227  6e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  31.18 
 
 
1078 aa  227  6e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  29.41 
 
 
1044 aa  226  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  39.59 
 
 
331 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  39.59 
 
 
331 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  39.59 
 
 
331 aa  224  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  44.28 
 
 
285 aa  224  6e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.34 
 
 
512 aa  220  7e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  49.76 
 
 
235 aa  215  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  45.45 
 
 
838 aa  214  3.9999999999999995e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  55.98 
 
 
232 aa  211  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  40.73 
 
 
358 aa  208  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  50.86 
 
 
274 aa  208  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  29.84 
 
 
1366 aa  207  5e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.67 
 
 
316 aa  207  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  40.69 
 
 
348 aa  206  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  41.53 
 
 
850 aa  206  2e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.47 
 
 
890 aa  205  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  26.94 
 
 
1200 aa  204  4e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.64 
 
 
811 aa  204  7e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  53.85 
 
 
252 aa  203  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.36 
 
 
593 aa  203  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  26.78 
 
 
1200 aa  202  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  44.4 
 
 
482 aa  198  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  50.77 
 
 
255 aa  196  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  37.2 
 
 
1281 aa  194  7e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.98 
 
 
278 aa  193  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  42.92 
 
 
264 aa  190  9e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  53.41 
 
 
208 aa  189  1e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  44.28 
 
 
301 aa  189  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.27 
 
 
270 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.58 
 
 
272 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0434  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 
464 aa  186  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  48.47 
 
 
245 aa  185  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  47.17 
 
 
839 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>