More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1310 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 341 aa  687    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  50.3 
 
 		 425 aa  312  5.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  53.04 
 
 		 831 aa  301  9e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  50.31 
 
 		 557 aa  285  9e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  49.16 
 
 		 489 aa  271  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  50.67 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  49.15 
 
 		 1402 aa  261  1e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  46.35 
 
 		 684 aa  261  1e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  45.03 
 
 		 685 aa  256  5e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  46.69 
 
 		 789 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  49.5 
 
 		 448 aa  250  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  45.02 
 
 		 1493 aa  249  5e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  47.16 
 
 		 961 aa  249  6e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  49.41 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  45.82 
 
 		 490 aa  243  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  45.82 
 
 		 490 aa  242  5e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  45.3 
 
 		 342 aa  242  7e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.55 
 
 		 528 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  43.39 
 
 		 1037 aa  237  2e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  44 
 
 		 305 aa  232  8.000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  46.25 
 
 		 380 aa  228  9e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.62 
 
 		 343 aa  223  3e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  44.91 
 
 		 271 aa  222  8e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  46.07 
 
 		 464 aa  219  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  50.21 
 
 		 256 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  48.06 
 
 		 392 aa  216  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  40.3 
 
 		 376 aa  206  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  41.44 
 
 		 1032 aa  205  9e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  40 
 
 		 376 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  37.91 
 
 		 1877 aa  204  1e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  42.37 
 
 		 1002 aa  203  3e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  38.71 
 
 		 509 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  38.71 
 
 		 509 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.12 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  38.71 
 
 		 509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  38.71 
 
 		 509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  40.66 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  43.46 
 
 		 552 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  39.35 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  37.85 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  39.86 
 
 		 976 aa  190  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.6 
 
 		 346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.13 
 
 		 380 aa  189  5e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  44.76 
 
 		 416 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.58 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  44.53 
 
 		 303 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  39.87 
 
 		 331 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  39.87 
 
 		 331 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  39.87 
 
 		 331 aa  185  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  38.89 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  37.46 
 
 		 680 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  46.9 
 
 		 2413 aa  181  1e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  51.27 
 
 		 235 aa  180  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  43.5 
 
 		 838 aa  179  7e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  38.24 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  38.69 
 
 		 331 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  45.22 
 
 		 482 aa  177  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.17 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  37.17 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  36.59 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  48.44 
 
 		 232 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  45.71 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  48.29 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  48.36 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  44.05 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  35.62 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  38.1 
 
 		 679 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  37.15 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  43.87 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  37.16 
 
 		 523 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  37.65 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  37.12 
 
 		 961 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  38.04 
 
 		 285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.92 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.79 
 
 		 865 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  36.39 
 
 		 850 aa  157  2e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  38.49 
 
 		 505 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  32.73 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  42.29 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.89 
 
 		 487 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  32.52 
 
 		 591 aa  152  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  40.89 
 
 		 839 aa  152  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  45.31 
 
 		 208 aa  152  1e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  34.11 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  36.42 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  33.91 
 
 		 348 aa  146  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  39.27 
 
 		 365 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  37.59 
 
 		 1430 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.27 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  38.67 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.23 
 
 		 890 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  40.35 
 
 		 254 aa  143  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.35 
 
 		 512 aa  143  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.74 
 
 		 272 aa  142  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.89 
 
 		 971 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.18 
 
 		 270 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  45.4 
 
 		 246 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  34.25 
 
 		 1200 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  34.25 
 
 		 1200 aa  139  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  37.94 
 
 		 971 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>