More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1053 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  81.18 
 
 		 680 aa  1066    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  100 
 
 		 679 aa  1371    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  34.63 
 
 		 1402 aa  356  1e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  39.5 
 
 		 684 aa  350  4e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  38.39 
 
 		 831 aa  343  4e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  34.85 
 
 		 961 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 1032 aa  277  5e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  29.66 
 
 		 685 aa  276  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  34.04 
 
 		 789 aa  267  4e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  34.62 
 
 		 557 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1493 aa  258  2e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  36.32 
 
 		 489 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  33.4 
 
 		 1037 aa  252  1e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1877 aa  251  4e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  34.26 
 
 		 490 aa  246  8e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  34.04 
 
 		 490 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 976 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 		 448 aa  227  7e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.03 
 
 		 528 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  37.67 
 
 		 393 aa  213  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.1 
 
 		 865 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  30.43 
 
 		 425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.1 
 
 		 341 aa  192  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.96 
 
 		 380 aa  192  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  33.99 
 
 		 464 aa  192  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  30.98 
 
 		 961 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  34.88 
 
 		 305 aa  181  4.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  28.3 
 
 		 1366 aa  179  1e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  35.85 
 
 		 376 aa  177  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  35.07 
 
 		 376 aa  177  6e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  37.26 
 
 		 380 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  35.06 
 
 		 380 aa  174  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.61 
 
 		 392 aa  169  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  30.75 
 
 		 509 aa  165  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  30.93 
 
 		 509 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  30.75 
 
 		 509 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  30.93 
 
 		 509 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.55 
 
 		 318 aa  164  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  24.72 
 
 		 693 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  30.23 
 
 		 1430 aa  162  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  31.83 
 
 		 373 aa  161  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  26.1 
 
 		 1078 aa  159  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  35.49 
 
 		 1002 aa  160  1e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  26.1 
 
 		 1044 aa  158  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  31.51 
 
 		 373 aa  158  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  30.52 
 
 		 591 aa  156  9e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  39.36 
 
 		 416 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.29 
 
 		 890 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  32.56 
 
 		 523 aa  154  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  36.18 
 
 		 359 aa  154  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  36.88 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  31.03 
 
 		 331 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.75 
 
 		 512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  32.55 
 
 		 331 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  34.24 
 
 		 331 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.17 
 
 		 343 aa  148  3e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  32.55 
 
 		 331 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  34.47 
 
 		 267 aa  148  4.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.23 
 
 		 325 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  33.23 
 
 		 325 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  33.02 
 
 		 327 aa  145  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  37.8 
 
 		 271 aa  145  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.93 
 
 		 346 aa  145  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  35.02 
 
 		 2413 aa  144  4e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  34.44 
 
 		 325 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.5 
 
 		 593 aa  139  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  27.98 
 
 		 1200 aa  138  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 303 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1281 aa  138  4e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  33.33 
 
 		 399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  27.77 
 
 		 1200 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  34.57 
 
 		 285 aa  134  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  34.36 
 
 		 329 aa  134  5e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  33.44 
 
 		 358 aa  134  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  37.28 
 
 		 256 aa  133  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  33.72 
 
 		 505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.19 
 
 		 811 aa  131  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.38 
 
 		 278 aa  131  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  37.24 
 
 		 235 aa  131  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  34.56 
 
 		 552 aa  130  6e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  29.64 
 
 		 348 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  28.44 
 
 		 838 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  42.93 
 
 		 255 aa  127  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.14 
 
 		 316 aa  127  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.82 
 
 		 487 aa  126  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  29.7 
 
 		 303 aa  124  5e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  31.14 
 
 		 850 aa  124  6e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  37.12 
 
 		 482 aa  124  7e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.61 
 
 		 971 aa  124  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  29.76 
 
 		 971 aa  123  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  37.01 
 
 		 301 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1680  Sel1 domain-containing protein  28.91 
 
 		 940 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.428252 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  32.9 
 
 		 264 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0434  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 464 aa  119  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 		 705 aa  117  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  35.42 
 
 		 245 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1108  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.73 
 
 		 342 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  25.76 
 
 		 985 aa  114  5e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  34.13 
 
 		 185 aa  114  5e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.5 
 
 		 255 aa  114  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>