More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1126 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 
487 aa  963    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  37.24 
 
 
1402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  32.05 
 
 
961 aa  246  8e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  34.32 
 
 
684 aa  244  3e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  39.61 
 
 
464 aa  231  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  32.51 
 
 
831 aa  230  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  32.52 
 
 
489 aa  225  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  30.33 
 
 
490 aa  219  8.999999999999998e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  30.55 
 
 
490 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  33.33 
 
 
789 aa  214  3.9999999999999995e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.89 
 
 
282 aa  200  5e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  32.09 
 
 
557 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30.75 
 
 
1493 aa  190  5e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.06 
 
 
392 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  31.42 
 
 
685 aa  184  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1876  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  40.16 
 
 
273 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0146933  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  33.96 
 
 
425 aa  177  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  36.43 
 
 
305 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 
1032 aa  171  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  32.62 
 
 
971 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 
976 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.02 
 
 
971 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  29.35 
 
 
448 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  32.52 
 
 
393 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.42 
 
 
316 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.03 
 
 
512 aa  154  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  25.81 
 
 
693 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.89 
 
 
341 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.65 
 
 
528 aa  150  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.16 
 
 
343 aa  149  9e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.28 
 
 
865 aa  148  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  37.4 
 
 
416 aa  146  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  28.22 
 
 
1877 aa  144  3e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  32 
 
 
505 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.56 
 
 
380 aa  142  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6892  Sel1 repeat-containing protein  37.11 
 
 
363 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  27 
 
 
985 aa  139  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.86 
 
 
318 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  31.92 
 
 
380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  25.85 
 
 
509 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  29.48 
 
 
961 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.17 
 
 
346 aa  134  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  25.85 
 
 
509 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.63 
 
 
798 aa  134  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  25.74 
 
 
1037 aa  133  6e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  26.1 
 
 
509 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  25.85 
 
 
509 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  32.45 
 
 
376 aa  131  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  28.96 
 
 
373 aa  130  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1740  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.71 
 
 
231 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000963659  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  31.79 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  28.69 
 
 
373 aa  129  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.29 
 
 
209 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  39.17 
 
 
301 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2180  Sel1 repeat-containing protein  29.04 
 
 
319 aa  127  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0570627  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  34.49 
 
 
358 aa  127  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  30.52 
 
 
331 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  32.08 
 
 
359 aa  126  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  26.35 
 
 
1200 aa  124  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  26.35 
 
 
1200 aa  124  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  35.18 
 
 
303 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  28.81 
 
 
523 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  36.18 
 
 
256 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  30.22 
 
 
342 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  26.42 
 
 
680 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  37.14 
 
 
276 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  36.9 
 
 
209 aa  118  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  35.75 
 
 
232 aa  117  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  37.02 
 
 
252 aa  117  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  23.51 
 
 
1044 aa  117  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  28.44 
 
 
1002 aa  117  6.9999999999999995e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  32.44 
 
 
482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  23.01 
 
 
1078 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  32.48 
 
 
264 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4115  Sel1 family protein  32.77 
 
 
374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4267  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.59 
 
 
373 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0418148  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  25.71 
 
 
679 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  29.14 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  28.09 
 
 
591 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  29.51 
 
 
838 aa  110  8.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.93 
 
 
325 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  27.53 
 
 
399 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  27.93 
 
 
325 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4244  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.15 
 
 
373 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.06 
 
 
811 aa  108  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.5 
 
 
890 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.81 
 
 
278 aa  107  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  25.43 
 
 
380 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  28.86 
 
 
331 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  28.86 
 
 
331 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  31.67 
 
 
271 aa  107  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  28.86 
 
 
331 aa  107  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  28.53 
 
 
536 aa  106  9e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  27.68 
 
 
285 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  34.13 
 
 
185 aa  105  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0247  CoA-binding domain-containing protein  34.47 
 
 
221 aa  105  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  32.39 
 
 
2413 aa  104  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  32.43 
 
 
552 aa  105  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  30.94 
 
 
315 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  29.32 
 
 
403 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>