More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0247 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0247  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
221 aa  456  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0589  Sel1 repeat-containing protein  71.57 
 
 
219 aa  310  1e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.47 
 
 
487 aa  105  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.58 
 
 
209 aa  101  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.63 
 
 
282 aa  100  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6892  Sel1 repeat-containing protein  37.78 
 
 
363 aa  92.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2180  Sel1 repeat-containing protein  32.52 
 
 
319 aa  91.7  9e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0570627  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1388  conserved hypothetical protein, tetratricopeptide repeat domain protein family  34.78 
 
 
184 aa  91.3  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  32.56 
 
 
1402 aa  89.7  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  36.13 
 
 
264 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  32.52 
 
 
831 aa  89.4  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  33.52 
 
 
684 aa  88.6  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1693  putative beta-lactamase HcpC (cysteine-richprotein C)  31.29 
 
 
265 aa  87  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  34.19 
 
 
232 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  37.69 
 
 
961 aa  85.9  4e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  29.71 
 
 
209 aa  85.9  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  35.03 
 
 
789 aa  85.5  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  35.62 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0323  beta-lactamase HcpA  32.41 
 
 
179 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.742387  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  33.12 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1876  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  36.54 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0146933  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  33.95 
 
 
1493 aa  81.6  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.43 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  29.7 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  30.46 
 
 
1037 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  30.43 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0736  beta-lactamase HcpA  36.89 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.519148  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.29 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.03 
 
 
1110 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  35.25 
 
 
489 aa  75.5  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1740  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.38 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000963659  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 
1910 aa  74.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  32.05 
 
 
490 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  29.58 
 
 
971 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.58 
 
 
971 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  32.1 
 
 
425 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  35.86 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  30.41 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  32.05 
 
 
490 aa  73.2  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  30.99 
 
 
359 aa  72.4  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  32.28 
 
 
685 aa  72  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 
392 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 
181 aa  71.2  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  28.57 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  34.51 
 
 
763 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2399  Sel1 domain-containing protein  26.39 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.26 
 
 
325 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  32.26 
 
 
325 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  33.33 
 
 
1078 aa  68.6  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  33.33 
 
 
1044 aa  68.6  0.00000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  31.94 
 
 
765 aa  68.6  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  31.69 
 
 
1200 aa  68.2  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0448  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.77 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.153887  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  31.69 
 
 
1200 aa  68.2  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.93 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  29.66 
 
 
1059 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0788  Sel1 domain-containing protein  31.11 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.191842 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  30.07 
 
 
2413 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0462  hypothetical protein  30.38 
 
 
234 aa  67  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.623472  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  28.14 
 
 
271 aa  67  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.51 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
798 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1602  Mrr restriction system protein (EcoKMrr)  33.03 
 
 
175 aa  67  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.492823  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  31.72 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  29.58 
 
 
315 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  31.45 
 
 
254 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  29.05 
 
 
505 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  30.66 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  31.34 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  29.23 
 
 
482 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.62 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  32.05 
 
 
838 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.93 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  32.54 
 
 
448 aa  66.6  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  31.61 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  39.42 
 
 
839 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  31.37 
 
 
693 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0437  hypothetical protein  29.75 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  29.94 
 
 
557 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  28.16 
 
 
304 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  28.49 
 
 
376 aa  65.1  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  32.59 
 
 
1877 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  30.43 
 
 
850 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
1032 aa  65.1  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.78 
 
 
316 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.58 
 
 
859 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  26.26 
 
 
276 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  31.5 
 
 
464 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1544  hypothetical protein  30.07 
 
 
234 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72263  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 
1430 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0178  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.74 
 
 
679 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  27.39 
 
 
193 aa  64.7  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.45 
 
 
528 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  32.5 
 
 
373 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  30.58 
 
 
416 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  38.78 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  30.97 
 
 
327 aa  63.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>