More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0323 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0323  beta-lactamase HcpA  100 
 
 
179 aa  357  7e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.742387  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.15 
 
 
282 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  36.94 
 
 
209 aa  107  8.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.86 
 
 
487 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  38.33 
 
 
305 aa  102  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  38.69 
 
 
271 aa  100  9e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  38.32 
 
 
425 aa  100  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0080  beta-lactamase HcpA  40.43 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141603  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6892  Sel1 repeat-containing protein  34.16 
 
 
363 aa  95.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1876  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  38.35 
 
 
273 aa  94.7  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0146933  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1388  conserved hypothetical protein, tetratricopeptide repeat domain protein family  31.52 
 
 
184 aa  94.4  7e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  36.51 
 
 
684 aa  93.2  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.62 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2180  Sel1 repeat-containing protein  39.23 
 
 
319 aa  92  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0570627  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.23 
 
 
341 aa  91.3  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  35.07 
 
 
1493 aa  87  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  40.8 
 
 
1402 aa  86.7  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1740  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.03 
 
 
231 aa  85.9  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000963659  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 
252 aa  85.5  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  36.8 
 
 
789 aa  85.5  4e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0247  CoA-binding domain-containing protein  32.41 
 
 
221 aa  84.3  7e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  39.55 
 
 
218 aa  84  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  31.51 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  37.6 
 
 
961 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  32.05 
 
 
489 aa  82  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0589  Sel1 repeat-containing protein  35.94 
 
 
219 aa  80.9  0.000000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1693  putative beta-lactamase HcpC (cysteine-richprotein C)  31.69 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  39.02 
 
 
1877 aa  77.8  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.6 
 
 
528 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  34.04 
 
 
464 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  32.28 
 
 
731 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  31.54 
 
 
838 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  33.09 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  31.25 
 
 
490 aa  75.9  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0736  beta-lactamase HcpA  34.31 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.519148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  29.69 
 
 
557 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  33.08 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.45 
 
 
318 aa  74.7  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  31.5 
 
 
448 aa  75.1  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.62 
 
 
392 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  31.75 
 
 
831 aa  74.3  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  29.94 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  30.56 
 
 
490 aa  73.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  38.39 
 
 
2413 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
976 aa  72.4  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0437  hypothetical protein  32.12 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  36.51 
 
 
301 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  33.54 
 
 
376 aa  70.9  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 
303 aa  70.9  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.9 
 
 
1012 aa  70.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  35.2 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1544  hypothetical protein  31.52 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72263  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  31.4 
 
 
1037 aa  68.9  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0462  hypothetical protein  35.16 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.623472  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.36 
 
 
316 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  31.09 
 
 
373 aa  68.6  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  30.58 
 
 
373 aa  68.2  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.88 
 
 
512 aa  67.8  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  31.25 
 
 
331 aa  67.8  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3190  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.06 
 
 
184 aa  67  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  32.46 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  33.98 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  31.29 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  30.83 
 
 
685 aa  65.5  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  30.95 
 
 
304 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  37.14 
 
 
254 aa  64.7  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  34.17 
 
 
1002 aa  64.7  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  31.15 
 
 
255 aa  64.7  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  34.43 
 
 
523 aa  64.7  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4291  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.04 
 
 
383 aa  64.3  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.233906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.16 
 
 
865 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.07 
 
 
343 aa  63.2  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  28.97 
 
 
241 aa  63.2  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.93 
 
 
1263 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.31 
 
 
1260 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.46 
 
 
346 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  32.35 
 
 
208 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.45 
 
 
1110 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  30.77 
 
 
536 aa  63.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  29.46 
 
 
331 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.71 
 
 
278 aa  62  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  29.46 
 
 
331 aa  62  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  30.94 
 
 
985 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  30 
 
 
482 aa  62  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.37 
 
 
380 aa  61.6  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  28.48 
 
 
172 aa  61.6  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  27.52 
 
 
403 aa  61.6  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  30.69 
 
 
331 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2156  serine protease  32.5 
 
 
134 aa  61.2  0.000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.178592  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  33.64 
 
 
357 aa  61.6  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  38.37 
 
 
315 aa  61.2  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  61.2  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.28 
 
 
255 aa  61.2  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.17 
 
 
222 aa  60.8  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  34.91 
 
 
346 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  32.52 
 
 
233 aa  60.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.63 
 
 
347 aa  60.8  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0647  Hsp12 variant C  27.22 
 
 
161 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>