More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2703 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 
693 aa  1413    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  33.55 
 
 
1402 aa  295  2e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  34.75 
 
 
684 aa  273  6e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  31.44 
 
 
961 aa  258  3e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  29.91 
 
 
831 aa  252  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 
1032 aa  218  2.9999999999999998e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  32.25 
 
 
789 aa  208  2e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30.99 
 
 
1493 aa  203  7e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  33.81 
 
 
490 aa  197  7e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  32.75 
 
 
490 aa  194  6e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  29.32 
 
 
685 aa  194  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  28.35 
 
 
557 aa  187  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  28.59 
 
 
1877 aa  187  8e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  30.37 
 
 
1037 aa  180  7e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  31.4 
 
 
489 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  31.05 
 
 
425 aa  173  7.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 
976 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  32.14 
 
 
380 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.69 
 
 
865 aa  157  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  31.89 
 
 
393 aa  157  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.68 
 
 
380 aa  156  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  24.96 
 
 
680 aa  153  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.81 
 
 
487 aa  153  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  29.95 
 
 
448 aa  150  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  25.43 
 
 
679 aa  147  8.000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.04 
 
 
528 aa  146  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  30.02 
 
 
464 aa  144  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  27.11 
 
 
380 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  32.34 
 
 
305 aa  142  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  26.42 
 
 
985 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  24.92 
 
 
1044 aa  132  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  25.08 
 
 
1078 aa  132  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  24.39 
 
 
961 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.01 
 
 
512 aa  130  8.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  35.47 
 
 
523 aa  130  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  26.07 
 
 
1366 aa  128  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  31.78 
 
 
331 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  25.96 
 
 
1200 aa  127  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  25.58 
 
 
1200 aa  126  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.85 
 
 
798 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.11 
 
 
341 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  27.42 
 
 
399 aa  122  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  27.4 
 
 
509 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  27.16 
 
 
509 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  29.63 
 
 
505 aa  118  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  27.16 
 
 
509 aa  119  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.19 
 
 
392 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.55 
 
 
318 aa  117  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  29.72 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  30.87 
 
 
325 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  29.86 
 
 
331 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  29.72 
 
 
376 aa  115  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  28.44 
 
 
342 aa  115  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  30.36 
 
 
331 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  28.66 
 
 
331 aa  114  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.86 
 
 
343 aa  113  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.18 
 
 
811 aa  112  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  34.23 
 
 
2413 aa  112  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  32.88 
 
 
267 aa  111  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  28.43 
 
 
373 aa  111  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.04 
 
 
278 aa  110  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  27.6 
 
 
509 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  29.81 
 
 
303 aa  110  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  28.2 
 
 
373 aa  109  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.76 
 
 
971 aa  109  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  26.76 
 
 
971 aa  109  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  31.98 
 
 
271 aa  109  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  30.18 
 
 
285 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0434  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 
464 aa  109  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  30.12 
 
 
416 aa  109  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  28.41 
 
 
358 aa  109  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  25.84 
 
 
1430 aa  109  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  27.18 
 
 
705 aa  109  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.27 
 
 
890 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.46 
 
 
316 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.13 
 
 
325 aa  107  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  28.13 
 
 
325 aa  107  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  31.45 
 
 
482 aa  107  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  30.53 
 
 
264 aa  106  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  27.73 
 
 
348 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  29.53 
 
 
327 aa  106  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  26.23 
 
 
1002 aa  105  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  27.49 
 
 
359 aa  104  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  31.35 
 
 
208 aa  102  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  24.21 
 
 
1281 aa  101  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  31.11 
 
 
235 aa  101  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0025  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 
842 aa  101  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000698246  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  32.51 
 
 
255 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  31.8 
 
 
329 aa  100  8e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  33.18 
 
 
315 aa  99.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 
303 aa  98.2  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  27.64 
 
 
1141 aa  97.8  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  31.55 
 
 
276 aa  96.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  27.12 
 
 
850 aa  95.9  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  30.52 
 
 
838 aa  95.9  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  29.02 
 
 
552 aa  95.5  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.2 
 
 
346 aa  95.5  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  30.72 
 
 
245 aa  94.7  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  32.82 
 
 
256 aa  94.7  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  29.93 
 
 
839 aa  93.6  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>