More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2180 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2180  Sel1 repeat-containing protein  100 
 
 		 319 aa  635    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0570627  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.88 
 
 		 282 aa  159  9e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  33.85 
 
 		 831 aa  145  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1876  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  36.86 
 
 		 273 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0146933  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  33.85 
 
 		 684 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.04 
 
 		 487 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.19 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  30.37 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  30.1 
 
 		 789 aa  124  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.95 
 
 		 209 aa  124  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  30.26 
 
 		 393 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  27.24 
 
 		 448 aa  119  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  30.34 
 
 		 961 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  29.35 
 
 		 685 aa  116  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  28.41 
 
 		 1493 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6892  Sel1 repeat-containing protein  30.57 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  31.7 
 
 		 490 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  31.7 
 
 		 490 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  30.97 
 
 		 557 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.74 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1693  putative beta-lactamase HcpC (cysteine-richprotein C)  29.49 
 
 		 265 aa  106  5e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  27.07 
 
 		 489 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  26.46 
 
 		 425 aa  104  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1037 aa  104  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  33.16 
 
 		 1877 aa  104  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 1032 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  29.64 
 
 		 464 aa  102  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.25 
 
 		 2413 aa  102  7e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  31.49 
 
 		 232 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  31.25 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  35.03 
 
 		 209 aa  100  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30 
 
 		 343 aa  99.8  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.09 
 
 		 528 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 		 380 aa  98.6  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  29.82 
 
 		 482 aa  97.8  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  31.84 
 
 		 838 aa  97.1  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  25.82 
 
 		 271 aa  97.1  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1388  conserved hypothetical protein, tetratricopeptide repeat domain protein family  37.75 
 
 		 184 aa  96.3  6e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  25.99 
 
 		 373 aa  96.3  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0462  hypothetical protein  30.99 
 
 		 234 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.623472  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0589  Sel1 repeat-containing protein  33.13 
 
 		 219 aa  95.5  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  25.63 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 976 aa  94.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0736  beta-lactamase HcpA  33.81 
 
 		 227 aa  92.8  6e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.519148  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.39 
 
 		 392 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1544  hypothetical protein  30.99 
 
 		 234 aa  92.8  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.52 
 
 		 316 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0323  beta-lactamase HcpA  39.23 
 
 		 179 aa  92  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.742387  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  30 
 
 		 235 aa  92  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  26.45 
 
 		 380 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0437  hypothetical protein  30.52 
 
 		 234 aa  91.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0247  CoA-binding domain-containing protein  32.52 
 
 		 221 aa  91.7  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  33.56 
 
 		 185 aa  91.7  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.9 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  29.83 
 
 		 523 aa  90.9  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  29 
 
 		 256 aa  90.5  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  30.45 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.68 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  25.86 
 
 		 331 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  24.2 
 
 		 264 aa  89.7  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1740  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.51 
 
 		 231 aa  88.2  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000963659  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  24.91 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1002 aa  85.9  8e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  28.96 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  26.07 
 
 		 705 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.95 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.58 
 
 		 865 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  30.41 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  25.95 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  24.68 
 
 		 693 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  26.14 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  23.88 
 
 		 359 aa  82.4  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  25.61 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  32.7 
 
 		 763 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  27.43 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  28.01 
 
 		 1281 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  25.23 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1141 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  25.23 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  29.56 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  25.95 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  25.57 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  24.07 
 
 		 416 aa  79.3  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1680  Sel1 domain-containing protein  29.02 
 
 		 940 aa  79.3  0.00000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.428252 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  26.74 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  27.54 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.9 
 
 		 512 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  26.59 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  34.04 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  24.14 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  29.71 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  25.63 
 
 		 1200 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  29.01 
 
 		 731 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  28.07 
 
 		 1910 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  26.85 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  28.14 
 
 		 552 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  27.8 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  24.4 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>