More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0104 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  100 
 
 
489 aa  981    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  53.99 
 
 
831 aa  446  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  54.23 
 
 
684 aa  437  1e-121  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  51 
 
 
557 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  48.36 
 
 
961 aa  394  1e-108  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  48.42 
 
 
1402 aa  392  1e-107  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  47.42 
 
 
685 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  48.77 
 
 
789 aa  372  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  48.57 
 
 
448 aa  360  4e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  45.71 
 
 
490 aa  353  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  45.24 
 
 
490 aa  348  2e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  42.47 
 
 
1493 aa  339  5e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  45 
 
 
393 aa  329  6e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  41.83 
 
 
1037 aa  320  3e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  46.65 
 
 
425 aa  318  2e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  39.12 
 
 
1032 aa  303  5.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.74 
 
 
528 aa  289  8e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  38.42 
 
 
1877 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  42.01 
 
 
509 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  49.16 
 
 
341 aa  271  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  41.75 
 
 
509 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  41.75 
 
 
509 aa  270  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  41.75 
 
 
509 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  37.98 
 
 
976 aa  264  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.86 
 
 
380 aa  259  6e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  40.49 
 
 
380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  42.09 
 
 
464 aa  254  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  48.84 
 
 
318 aa  249  7e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  46.72 
 
 
305 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  36.18 
 
 
680 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  43.27 
 
 
1002 aa  238  1e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  46.56 
 
 
380 aa  237  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.46 
 
 
343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  36.32 
 
 
679 aa  234  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  42.81 
 
 
342 aa  229  7e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  52.05 
 
 
256 aa  229  9e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  40.56 
 
 
505 aa  228  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.52 
 
 
487 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  39.41 
 
 
376 aa  223  6e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  42.32 
 
 
359 aa  223  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  40.98 
 
 
376 aa  222  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.87 
 
 
865 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  49.01 
 
 
416 aa  221  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.3 
 
 
392 aa  221  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  44.15 
 
 
303 aa  219  7e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  49.78 
 
 
2413 aa  219  1e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  42.55 
 
 
271 aa  218  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  36 
 
 
523 aa  215  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.78 
 
 
346 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  32.56 
 
 
1430 aa  209  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  40.3 
 
 
373 aa  208  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.58 
 
 
512 aa  208  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  44.44 
 
 
358 aa  208  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  40.91 
 
 
399 aa  207  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  38.23 
 
 
373 aa  203  7e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  45.73 
 
 
267 aa  202  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  36.25 
 
 
961 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  48.64 
 
 
235 aa  198  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  42.26 
 
 
838 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  43.89 
 
 
552 aa  195  2e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  49.06 
 
 
316 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  50 
 
 
252 aa  194  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  35.31 
 
 
591 aa  192  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  36.5 
 
 
348 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.92 
 
 
325 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  38.92 
 
 
325 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  40.48 
 
 
331 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  50.75 
 
 
232 aa  191  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  39.24 
 
 
325 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  37.91 
 
 
331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  37.66 
 
 
327 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.78 
 
 
798 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  37.58 
 
 
331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  46.29 
 
 
255 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  37.58 
 
 
331 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  31.94 
 
 
1078 aa  183  8.000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.25 
 
 
278 aa  182  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  31.24 
 
 
1044 aa  181  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  46.58 
 
 
839 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.71 
 
 
890 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  31.4 
 
 
693 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  38.11 
 
 
850 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  26.89 
 
 
1366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  41.33 
 
 
285 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  40.62 
 
 
329 aa  173  5e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  40.43 
 
 
482 aa  171  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  47.51 
 
 
274 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.76 
 
 
971 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  37.09 
 
 
971 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.77 
 
 
321 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  40.24 
 
 
264 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  39.27 
 
 
293 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  31.76 
 
 
985 aa  164  3e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  43.69 
 
 
254 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  30.53 
 
 
1141 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  33.71 
 
 
705 aa  164  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  45.59 
 
 
245 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.44 
 
 
282 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  29 
 
 
536 aa  163  6e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  35.61 
 
 
303 aa  162  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>