More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1504 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 528 aa  1079    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  39.59 
 
 		 831 aa  333  5e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  37.57 
 
 		 557 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  39.54 
 
 		 1402 aa  317  3e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  38.72 
 
 		 684 aa  312  9e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  37.04 
 
 		 961 aa  294  3e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  39.91 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  38.74 
 
 		 489 aa  289  9e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  35.83 
 
 		 685 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  36.34 
 
 		 1493 aa  268  1e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  34.69 
 
 		 789 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  34.76 
 
 		 490 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  34.56 
 
 		 490 aa  261  3e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  45.03 
 
 		 393 aa  246  9e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  35.43 
 
 		 1877 aa  241  2e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 		 1032 aa  241  2.9999999999999997e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.55 
 
 		 341 aa  239  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  32.39 
 
 		 1037 aa  233  5e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.75 
 
 		 318 aa  232  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  43.27 
 
 		 342 aa  222  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  46.18 
 
 		 271 aa  219  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  43.75 
 
 		 305 aa  218  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  34.34 
 
 		 448 aa  209  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 976 aa  209  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  30.24 
 
 		 680 aa  207  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  42.05 
 
 		 303 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.87 
 
 		 380 aa  199  7e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.17 
 
 		 278 aa  192  9e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  34.75 
 
 		 380 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.7 
 
 		 346 aa  189  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  32.39 
 
 		 464 aa  189  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  31.46 
 
 		 679 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  33.64 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  39.01 
 
 		 416 aa  186  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  45.33 
 
 		 2413 aa  184  3e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  38.46 
 
 		 376 aa  183  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  33.77 
 
 		 380 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  39.27 
 
 		 376 aa  182  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  37.26 
 
 		 509 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  37.26 
 
 		 509 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  37.26 
 
 		 509 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  42.25 
 
 		 838 aa  180  5.999999999999999e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  44.06 
 
 		 235 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  36.94 
 
 		 509 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.58 
 
 		 343 aa  176  7e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  40.68 
 
 		 482 aa  176  7e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  47.69 
 
 		 274 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  38.01 
 
 		 552 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  35.54 
 
 		 1002 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  38.43 
 
 		 373 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  38.43 
 
 		 373 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.64 
 
 		 316 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  36.19 
 
 		 331 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  44.09 
 
 		 256 aa  171  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  37.37 
 
 		 359 aa  170  7e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  36.94 
 
 		 331 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  36.94 
 
 		 331 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  36.94 
 
 		 331 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  44.95 
 
 		 255 aa  166  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  40.68 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  37 
 
 		 303 aa  163  6e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  37.84 
 
 		 267 aa  162  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  29.86 
 
 		 1078 aa  162  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.18 
 
 		 865 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  29.12 
 
 		 1366 aa  160  8e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.69 
 
 		 392 aa  160  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  29.67 
 
 		 1044 aa  159  9e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  36.02 
 
 		 264 aa  159  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  38.77 
 
 		 839 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  44.78 
 
 		 252 aa  159  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  28.6 
 
 		 591 aa  157  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  42.51 
 
 		 254 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  37.74 
 
 		 523 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  37.86 
 
 		 329 aa  155  2e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  33.96 
 
 		 348 aa  154  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  42.27 
 
 		 232 aa  153  8.999999999999999e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  39.81 
 
 		 245 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  34.86 
 
 		 850 aa  152  1e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  27.73 
 
 		 961 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.72 
 
 		 272 aa  150  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  28.98 
 
 		 1430 aa  150  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  34.23 
 
 		 325 aa  150  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.65 
 
 		 487 aa  150  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.8 
 
 		 325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  34.8 
 
 		 325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.62 
 
 		 798 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.08 
 
 		 512 aa  147  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  41.12 
 
 		 365 aa  147  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  44.57 
 
 		 731 aa  147  7.0000000000000006e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.12 
 
 		 321 aa  146  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  27.04 
 
 		 693 aa  146  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  34.92 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.18 
 
 		 270 aa  145  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  34.07 
 
 		 327 aa  144  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  46.2 
 
 		 1281 aa  144  6e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  35.06 
 
 		 285 aa  143  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  27.31 
 
 		 1200 aa  143  8e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  27.31 
 
 		 1200 aa  143  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  30.61 
 
 		 505 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  45.35 
 
 		 208 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>