More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6186 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 316 aa  620  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  63.67 
 
 		 392 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  59.85 
 
 		 464 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  59.92 
 
 		 301 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  50.94 
 
 		 1402 aa  237  2e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  45.93 
 
 		 425 aa  229  5e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  42.67 
 
 		 831 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  41.45 
 
 		 305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  47.94 
 
 		 684 aa  226  6e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  49.01 
 
 		 1493 aa  220  3e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.12 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  44.56 
 
 		 961 aa  217  2e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  46.74 
 
 		 789 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  49.06 
 
 		 489 aa  210  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  43.09 
 
 		 557 aa  209  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  44.22 
 
 		 685 aa  205  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  45.69 
 
 		 490 aa  202  5e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  45.32 
 
 		 490 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  40.2 
 
 		 1032 aa  198  9e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  44.19 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  49.77 
 
 		 1877 aa  194  2e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.02 
 
 		 343 aa  193  3e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  43.86 
 
 		 448 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.44 
 
 		 318 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.64 
 
 		 528 aa  186  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  44.28 
 
 		 552 aa  185  8e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  43.23 
 
 		 416 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  38.87 
 
 		 976 aa  178  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  45.54 
 
 		 838 aa  177  3e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.64 
 
 		 346 aa  175  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  39.13 
 
 		 331 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.86 
 
 		 487 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  38.35 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  38.49 
 
 		 1037 aa  170  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.04 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.2 
 
 		 865 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  36.96 
 
 		 331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.56 
 
 		 325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  36.59 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  36.59 
 
 		 331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  39.56 
 
 		 325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.08 
 
 		 380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  39.13 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.94 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  42.32 
 
 		 303 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  38.46 
 
 		 327 aa  159  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  41.13 
 
 		 376 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  37.99 
 
 		 285 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  41.13 
 
 		 376 aa  159  8e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  39.71 
 
 		 264 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  44.35 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  46.46 
 
 		 235 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  40.09 
 
 		 271 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  39.07 
 
 		 380 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  47.03 
 
 		 232 aa  151  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  38.98 
 
 		 329 aa  149  4e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  42.73 
 
 		 2413 aa  149  6e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  35.92 
 
 		 509 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  35.92 
 
 		 509 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  35.95 
 
 		 509 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  40.82 
 
 		 373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  38.7 
 
 		 971 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  35.95 
 
 		 509 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  35.81 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.31 
 
 		 971 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  35.49 
 
 		 399 aa  145  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  40.29 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  39.13 
 
 		 1002 aa  145  1e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.32 
 
 		 798 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 512 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  38.96 
 
 		 482 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  39.18 
 
 		 358 aa  143  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  44.22 
 
 		 252 aa  142  6e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  35.57 
 
 		 850 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  38.13 
 
 		 985 aa  139  6e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1876  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  39.56 
 
 		 273 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0146933  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  35.29 
 
 		 961 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  34.98 
 
 		 380 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  43.14 
 
 		 274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  34.64 
 
 		 680 aa  136  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  36.4 
 
 		 679 aa  136  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  32.73 
 
 		 303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  40.43 
 
 		 255 aa  135  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  34.9 
 
 		 505 aa  135  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.23 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  38.96 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  42.23 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  40.86 
 
 		 731 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  37.66 
 
 		 415 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  36.57 
 
 		 523 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.18 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  42.94 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.33 
 
 		 272 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  34.88 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  43.26 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.55 
 
 		 416 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  35.82 
 
 		 1044 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  35.82 
 
 		 1078 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  37.35 
 
 		 1200 aa  126  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  44.91 
 
 		 185 aa  125  9e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>