More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1388 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1388  conserved hypothetical protein, tetratricopeptide repeat domain protein family  100 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.16 
 
 		 282 aa  112  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.96 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  35.03 
 
 		 209 aa  104  7e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1740  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.66 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000963659  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6892  Sel1 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 363 aa  100  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.22 
 
 		 487 aa  98.6  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1876  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  44.93 
 
 		 273 aa  98.2  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0146933  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2180  Sel1 repeat-containing protein  37.75 
 
 		 319 aa  96.3  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0570627  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0323  beta-lactamase HcpA  31.52 
 
 		 179 aa  94.4  8e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.742387  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0247  CoA-binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 221 aa  91.3  7e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  40.65 
 
 		 373 aa  90.1  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  40.65 
 
 		 373 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  37.41 
 
 		 684 aa  89.7  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  37.78 
 
 		 1493 aa  89.7  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  32.28 
 
 		 232 aa  89.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  38.71 
 
 		 789 aa  89.4  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0589  Sel1 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 219 aa  88.2  6e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  32.89 
 
 		 305 aa  87.8  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  35.56 
 
 		 1402 aa  87.8  8e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  33.57 
 
 		 557 aa  86.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0736  beta-lactamase HcpA  33.51 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.519148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  28.48 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0462  hypothetical protein  31.05 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.623472  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1544  hypothetical protein  30.53 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72263  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  31.95 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  35.25 
 
 		 961 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  28.49 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.18 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0437  hypothetical protein  30 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  32.47 
 
 		 831 aa  79.7  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  33.61 
 
 		 693 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 		 1032 aa  79  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  29.63 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  33.56 
 
 		 985 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  28.31 
 
 		 489 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  34.11 
 
 		 464 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  31.85 
 
 		 376 aa  75.9  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.72 
 
 		 392 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  37.69 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  33.09 
 
 		 685 aa  76.3  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  33.75 
 
 		 552 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  30.87 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  35.77 
 
 		 490 aa  74.7  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.11 
 
 		 341 aa  74.7  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  31.11 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  33.1 
 
 		 838 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.57 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0080  beta-lactamase HcpA  29.89 
 
 		 169 aa  72  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141603  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  31.54 
 
 		 342 aa  71.2  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  41.84 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  29.73 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  30.4 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1693  putative beta-lactamase HcpC (cysteine-richprotein C)  28.57 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  34.15 
 
 		 490 aa  70.1  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  32.12 
 
 		 1002 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3190  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.27 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  31.29 
 
 		 399 aa  68.6  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 976 aa  68.6  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  26.23 
 
 		 359 aa  68.2  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  34.07 
 
 		 1281 aa  68.2  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  37.82 
 
 		 304 aa  67.8  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  26.17 
 
 		 448 aa  67.8  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  35.24 
 
 		 208 aa  67  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  33.61 
 
 		 368 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2145  Sel1 repeat-containing protein  27.55 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000020662  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  27.78 
 
 		 482 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  28.74 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.22 
 
 		 528 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  32.45 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  33.87 
 
 		 368 aa  65.5  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  33.33 
 
 		 329 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  31.16 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  32.12 
 
 		 765 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1037 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  30 
 
 		 1200 aa  64.3  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.69 
 
 		 2413 aa  64.7  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  31.36 
 
 		 255 aa  64.3  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  30 
 
 		 1200 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.45 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  32.52 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  33.09 
 
 		 731 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.6 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  26.56 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  29.61 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  37.27 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.23 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0432  hypothetical protein  33.04 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  25.36 
 
 		 245 aa  62  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  28.3 
 
 		 410 aa  62  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  26.77 
 
 		 509 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  26.77 
 
 		 509 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4115  Sel1 family protein  35.37 
 
 		 374 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  26.77 
 
 		 509 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  26.77 
 
 		 509 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3521  Sel1 domain-containing protein  31.08 
 
 		 387 aa  62  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.894704  normal  0.280761 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  27.27 
 
 		 415 aa  61.6  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.83 
 
 		 1110 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>