132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2145 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2145  Sel1 repeat-containing protein  100 
 
 
186 aa  382  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000020662  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6892  Sel1 repeat-containing protein  38.05 
 
 
363 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.5 
 
 
487 aa  71.6  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  30.77 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1388  conserved hypothetical protein, tetratricopeptide repeat domain protein family  27.55 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1876  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  34.78 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0146933  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1740  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.36 
 
 
231 aa  64.7  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000963659  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0736  beta-lactamase HcpA  27.93 
 
 
227 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.519148  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.77 
 
 
282 aa  62.8  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.77 
 
 
209 aa  62  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2180  Sel1 repeat-containing protein  27.07 
 
 
319 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0570627  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1693  putative beta-lactamase HcpC (cysteine-richprotein C)  30.88 
 
 
265 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0527  Sel1 domain-containing protein  31.9 
 
 
284 aa  58.9  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0080  beta-lactamase HcpA  35.42 
 
 
169 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141603  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0247  CoA-binding domain-containing protein  30.51 
 
 
221 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  31.19 
 
 
684 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  31.58 
 
 
789 aa  55.1  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  27.93 
 
 
255 aa  54.7  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4035  Sel1 domain-containing protein  26.27 
 
 
277 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.163286 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0126  putative cytochrome c-type haem-binding periplasmic protein  34.45 
 
 
180 aa  54.3  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.960436  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  30.25 
 
 
260 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0694  Sel1 domain-containing protein  29.41 
 
 
239 aa  53.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.55689  normal  0.902346 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.7 
 
 
890 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3190  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.21 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  30.43 
 
 
523 aa  52.8  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0647  Hsp12 variant C  28.21 
 
 
161 aa  52.8  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2296  Sel1 domain-containing protein  27.45 
 
 
342 aa  52.4  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.207765  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  26.85 
 
 
331 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  29.36 
 
 
1493 aa  51.2  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  29.17 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  30.91 
 
 
393 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  28.45 
 
 
557 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  28.12 
 
 
416 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.88 
 
 
341 aa  50.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0462  hypothetical protein  22.6 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.623472  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  27.62 
 
 
680 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 
976 aa  50.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0437  hypothetical protein  23.29 
 
 
234 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0323  beta-lactamase HcpA  22.58 
 
 
179 aa  50.4  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.742387  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  28.44 
 
 
961 aa  50.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  31.19 
 
 
1402 aa  50.1  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  27.97 
 
 
267 aa  49.3  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1747  hypothetical protein  28 
 
 
228 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  25 
 
 
373 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  25.51 
 
 
489 aa  49.3  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1544  hypothetical protein  23.29 
 
 
234 aa  49.3  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72263  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  25.69 
 
 
373 aa  48.9  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1532  Sel1 domain-containing protein  32.35 
 
 
746 aa  48.9  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00292625  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  28.04 
 
 
2413 aa  48.9  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.45 
 
 
346 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.07 
 
 
278 aa  48.5  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  26.45 
 
 
1002 aa  48.5  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  28.04 
 
 
831 aa  48.1  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0589  Sel1 repeat-containing protein  30.51 
 
 
219 aa  47.8  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1337  Sel1 domain-containing protein  24.37 
 
 
181 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0906035  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.97 
 
 
865 aa  47.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  26.42 
 
 
342 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  28.45 
 
 
303 aa  47  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0528  Sel1 domain-containing protein  26.72 
 
 
274 aa  47.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  25.66 
 
 
235 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  24.55 
 
 
305 aa  47  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  27.73 
 
 
348 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  25.96 
 
 
679 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  29.17 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  27.78 
 
 
1078 aa  46.6  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  27.78 
 
 
1044 aa  46.6  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4119  Sel1 domain-containing protein  25.89 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.59 
 
 
528 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  30 
 
 
304 aa  47  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  25.19 
 
 
245 aa  45.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.68 
 
 
225 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  26.55 
 
 
232 aa  45.8  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  23.42 
 
 
231 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  28.07 
 
 
1200 aa  45.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  26.05 
 
 
490 aa  45.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  28.07 
 
 
1200 aa  45.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  27.88 
 
 
221 aa  45.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2980  Sel1 domain-containing protein  24.71 
 
 
254 aa  45.1  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  27.18 
 
 
384 aa  45.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.14 
 
 
811 aa  45.1  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  26.05 
 
 
490 aa  45.1  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.93 
 
 
318 aa  45.1  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  25.45 
 
 
234 aa  45.1  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  29.81 
 
 
117 aa  44.7  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  28.16 
 
 
264 aa  44.7  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3521  Sel1 domain-containing protein  27.27 
 
 
387 aa  44.7  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.894704  normal  0.280761 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  27.62 
 
 
425 aa  44.7  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  24.14 
 
 
693 aa  44.7  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  27.5 
 
 
276 aa  44.7  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  26.32 
 
 
274 aa  44.7  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0250  Sel1 repeat-containing protein  24.48 
 
 
191 aa  44.7  0.0009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00025154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  25.74 
 
 
271 aa  43.9  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3249  Sel1 domain-containing protein  26.36 
 
 
289 aa  43.9  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3360  serine/threonine protein kinase  43.08 
 
 
656 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  24.2 
 
 
978 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  27.52 
 
 
380 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3066  Sel1 repeat-containing protein  22.83 
 
 
432 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  27.12 
 
 
552 aa  43.5  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.32 
 
 
294 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>