219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0080 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0080  beta-lactamase HcpA  100 
 
 		 169 aa  333  7.999999999999999e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141603  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0647  Hsp12 variant C  44.97 
 
 		 161 aa  150  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  40.37 
 
 		 209 aa  122  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0323  beta-lactamase HcpA  40.43 
 
 		 179 aa  99.4  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.742387  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.67 
 
 		 209 aa  97.1  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.64 
 
 		 282 aa  85.5  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 487 aa  82.4  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1876  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  36.97 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0146933  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6892  Sel1 repeat-containing protein  32.64 
 
 		 363 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1388  conserved hypothetical protein, tetratricopeptide repeat domain protein family  29.89 
 
 		 184 aa  72  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  34.71 
 
 		 489 aa  68.6  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0736  beta-lactamase HcpA  30.11 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.519148  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  36.67 
 
 		 254 aa  67.8  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0437  hypothetical protein  28.22 
 
 		 234 aa  67.8  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  31.82 
 
 		 208 aa  67  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0589  Sel1 repeat-containing protein  34 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  33.64 
 
 		 838 aa  64.3  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1740  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.92 
 
 		 231 aa  64.3  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000963659  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0462  hypothetical protein  27.23 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.623472  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  33.08 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2180  Sel1 repeat-containing protein  29.55 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0570627  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4115  Sel1 family protein  35.45 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1402 aa  62  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  29.75 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  32.31 
 
 		 376 aa  61.6  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1544  hypothetical protein  26.73 
 
 		 234 aa  61.2  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72263  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.65 
 
 		 222 aa  60.8  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  30.66 
 
 		 789 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.8 
 
 		 684 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  30.53 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4244  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2156  serine protease  36.09 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.178592  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 		 1032 aa  58.5  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3190  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.5 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0326  Sel1 domain-containing protein  29.45 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452789  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.47 
 
 		 512 aa  58.5  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 303 aa  58.2  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0247  CoA-binding domain-containing protein  30 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 252 aa  57.8  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  30.14 
 
 		 731 aa  57.8  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4267  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35 
 
 		 373 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0418148  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  27.94 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  34.68 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  30 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0465  hypothetical protein  34.41 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.730407 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2038  molybdopterin biosynthesis protein  34.15 
 
 		 136 aa  57  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.244571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  27.48 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2145  Sel1 repeat-containing protein  35.42 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000020662  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00376  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0626977  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  27.94 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  34.43 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  23.94 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  26.62 
 
 		 693 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00380  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.067351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0500  hypothetical protein  33.33 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113871  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0460  hypothetical protein  33.33 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392011  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.91 
 
 		 392 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  33.6 
 
 		 393 aa  55.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  31.09 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.54 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  36.67 
 
 		 464 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  31.78 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  26.45 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  41.18 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.1 
 
 		 316 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  35.29 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  29.84 
 
 		 961 aa  54.3  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  30.34 
 
 		 1044 aa  53.9  0.0000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.2 
 
 		 859 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  30.11 
 
 		 482 aa  53.9  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  28.91 
 
 		 705 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1877 aa  53.1  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  36.36 
 
 		 267 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 		 270 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  37.63 
 
 		 552 aa  53.1  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2399  Sel1 domain-containing protein  31.75 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.33 
 
 		 278 aa  53.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  25.76 
 
 		 1078 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.69 
 
 		 890 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.05 
 
 		 341 aa  52.4  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1693  putative beta-lactamase HcpC (cysteine-richprotein C)  26.53 
 
 		 265 aa  52.4  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  31.16 
 
 		 831 aa  52  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  27.59 
 
 		 765 aa  51.6  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  33.33 
 
 		 331 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.48 
 
 		 363 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  27.34 
 
 		 233 aa  51.6  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  28.89 
 
 		 359 aa  51.2  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  32 
 
 		 1037 aa  51.2  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  33.33 
 
 		 331 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  32.05 
 
 		 348 aa  51.2  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  33.04 
 
 		 218 aa  51.2  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  28.03 
 
 		 264 aa  51.2  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  33.33 
 
 		 331 aa  50.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  25.18 
 
 		 245 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  30.3 
 
 		 305 aa  50.4  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.46 
 
 		 528 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  34.52 
 
 		 327 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  34.94 
 
 		 285 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>