More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0465 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0465  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  649    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.730407 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00376  hypothetical protein  95.18 
 
 		 311 aa  620  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0626977  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0460  hypothetical protein  94.86 
 
 		 331 aa  617  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0500  hypothetical protein  94.86 
 
 		 331 aa  617  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00380  hypothetical protein  95.35 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.067351  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2996  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.85 
 
 		 485 aa  176  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1277  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.93 
 
 		 481 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0539  hypothetical protein  37.41 
 
 		 503 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0484  hypothetical protein  37.41 
 
 		 503 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0325737 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0478  hypothetical protein  37.28 
 
 		 503 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0476  putative periplasmic protein  36.3 
 
 		 503 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0479  tetratricopeptide repeat protein  37.11 
 
 		 497 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.786454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0540  tetratricopeptide repeat protein  37.11 
 
 		 497 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.653123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0485  tetratricopeptide repeat protein  37.11 
 
 		 497 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791443 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0477  tetratricopeptide repeat protein  36.72 
 
 		 496 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.486757  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  38.26 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  32.65 
 
 		 789 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  38.52 
 
 		 765 aa  72  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  40 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  41.96 
 
 		 1402 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  36.15 
 
 		 1493 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.18 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  36.92 
 
 		 831 aa  69.7  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  36.97 
 
 		 684 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  38.98 
 
 		 961 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  38.46 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  38.84 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  39.29 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  34.31 
 
 		 680 aa  67  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.67 
 
 		 341 aa  67  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  27.23 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  39.29 
 
 		 838 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0442  Sel1 domain-containing protein  34.18 
 
 		 512 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.375518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.48 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  36.15 
 
 		 181 aa  65.5  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3510  Sel1 domain-containing protein  38.14 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.765295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3685  Sel1 domain-containing protein  35.16 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  35.78 
 
 		 976 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  40.83 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  40.91 
 
 		 1877 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  42.86 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  42.86 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.81 
 
 		 528 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  34.17 
 
 		 679 aa  62.8  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  39.77 
 
 		 971 aa  62.4  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.51 
 
 		 565 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4139  hypothetical protein  36.22 
 
 		 514 aa  62.4  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0068  hypothetical protein  37.86 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  33.91 
 
 		 1037 aa  62  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0610  hypothetical protein  37.86 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  36.29 
 
 		 241 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.84 
 
 		 890 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  37.27 
 
 		 731 aa  62  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1359  hypothetical protein  37.86 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129573  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.64 
 
 		 971 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0429  hypothetical protein  37.86 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417467  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3872  Sel1 domain-containing protein  32.87 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0228743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3203  hypothetical protein  37.86 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0234  hypothetical protein  37.86 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  33.64 
 
 		 552 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  38.18 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  39.81 
 
 		 1002 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  34.21 
 
 		 685 aa  60.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  38.53 
 
 		 2413 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  34.71 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3746  Sel1 domain-containing protein  32.17 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3689  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.17 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.292341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0579  Sel1 domain-containing protein  32.17 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171088  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  36.52 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.59 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.87 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1532  Sel1 domain-containing protein  34.23 
 
 		 746 aa  59.3  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00292625  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  34.82 
 
 		 490 aa  59.3  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  37.65 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0448  hypothetical protein  36.89 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.325854  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0625  hypothetical protein  32.17 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0371  hypothetical protein  36.89 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140367  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1430  Sel1 domain-containing protein  33.64 
 
 		 942 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356598 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0483  Sel1 domain-containing protein  38.6 
 
 		 511 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0431486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  34.55 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  38.1 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  34.62 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  30.71 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  34.17 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  37.8 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0080  beta-lactamase HcpA  34.41 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141603  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3827  Sel1 domain-containing protein  36.61 
 
 		 485 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  35.25 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0462  Sel1 domain-containing protein  37.72 
 
 		 511 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.781261  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0619  Sel1 domain-containing protein  32.17 
 
 		 259 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0168047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0618  Sel1 domain-containing protein  32.17 
 
 		 259 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000151187  normal  0.335089 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3872  Sel1 domain-containing protein  32.5 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000147421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3857  Sel1 domain-containing protein  37.72 
 
 		 511 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.277473  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3508  Sel1 domain-containing protein  30.49 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00034309  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  38.53 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2399  Sel1 domain-containing protein  34.55 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  34.82 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 		 448 aa  56.2  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>