More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1992 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  100 
 
 
233 aa  463  9.999999999999999e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  38.73 
 
 
684 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  37.62 
 
 
961 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  38.1 
 
 
1402 aa  123  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  32.3 
 
 
235 aa  122  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  36.14 
 
 
1037 aa  119  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  38.89 
 
 
789 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  36.19 
 
 
557 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  36.14 
 
 
831 aa  115  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  35.96 
 
 
425 aa  115  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.73 
 
 
318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  30.53 
 
 
264 aa  113  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.67 
 
 
380 aa  112  5e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  33.74 
 
 
376 aa  111  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  34.8 
 
 
393 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.5 
 
 
448 aa  108  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  30.97 
 
 
489 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  32.92 
 
 
376 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  36.21 
 
 
838 aa  107  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  34.16 
 
 
490 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  34.16 
 
 
490 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  32.76 
 
 
416 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  33.17 
 
 
305 aa  103  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  36.71 
 
 
208 aa  102  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.88 
 
 
346 aa  102  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  32.65 
 
 
2413 aa  102  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.95 
 
 
209 aa  102  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  32.51 
 
 
373 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  36.16 
 
 
1877 aa  101  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  32.5 
 
 
232 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  32.02 
 
 
373 aa  99.4  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  31.79 
 
 
241 aa  99  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  41.67 
 
 
329 aa  98.6  7e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  34.1 
 
 
1493 aa  98.2  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  32.51 
 
 
685 aa  96.3  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  34.62 
 
 
172 aa  96.3  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  38.26 
 
 
185 aa  95.9  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.42 
 
 
278 aa  95.9  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32 
 
 
528 aa  94.7  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  34.85 
 
 
255 aa  95.1  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.74 
 
 
343 aa  94.7  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  31.9 
 
 
267 aa  94  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  35.82 
 
 
464 aa  94  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 
303 aa  93.6  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.04 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  29.87 
 
 
254 aa  92.8  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 
181 aa  92.4  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  37.89 
 
 
193 aa  92  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.04 
 
 
225 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  30.39 
 
 
342 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  33.66 
 
 
1002 aa  90.9  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  34.93 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.99 
 
 
270 aa  90.9  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.47 
 
 
325 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  36.18 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  35.47 
 
 
325 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 
252 aa  89.4  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  33.73 
 
 
380 aa  89  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.46 
 
 
211 aa  88.2  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
976 aa  88.2  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  29.81 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 
1032 aa  87  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  34.88 
 
 
327 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.18 
 
 
341 aa  87.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  34.88 
 
 
285 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  35.66 
 
 
679 aa  86.3  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0477  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 
275 aa  86.3  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.535577  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1430  Sel1 domain-containing protein  35.43 
 
 
942 aa  85.9  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.356598 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.43 
 
 
865 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  36.29 
 
 
680 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  27.23 
 
 
482 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.04 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.58 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.22 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.27 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  38.76 
 
 
552 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  41.13 
 
 
218 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.4 
 
 
890 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  29.59 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  29.3 
 
 
839 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  31.37 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  29.17 
 
 
380 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2868  Sel1 domain-containing protein  29.53 
 
 
245 aa  82.4  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215406  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  36.92 
 
 
367 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.66 
 
 
392 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.18 
 
 
512 aa  82.4  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  33.72 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1651  hypothetical protein  36.51 
 
 
362 aa  82  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.563504  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  32.52 
 
 
366 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  36.43 
 
 
246 aa  82  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_004310  BR1708  hypothetical protein  36.51 
 
 
362 aa  82  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  35.26 
 
 
301 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  36.64 
 
 
368 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  27.54 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  42.06 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  31.67 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  32.22 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 
763 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  32.18 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.86 
 
 
487 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>