More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1484 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 246 aa  500  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  37.08 
 
 		 241 aa  169  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  41.67 
 
 		 489 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  40.64 
 
 		 448 aa  148  8e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  45.83 
 
 		 831 aa  143  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  43.81 
 
 		 557 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  47.02 
 
 		 425 aa  142  4e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  38.86 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.4 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  44.44 
 
 		 393 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.66 
 
 		 1012 aa  133  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  43.53 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  39.89 
 
 		 359 aa  131  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  37.31 
 
 		 1037 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  39.59 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  40.31 
 
 		 376 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  46.43 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  40.1 
 
 		 376 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  35.98 
 
 		 303 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  41.88 
 
 		 685 aa  129  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  38.05 
 
 		 271 aa  128  7.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.12 
 
 		 318 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  40.43 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  40.33 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  38.34 
 
 		 789 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  42.33 
 
 		 1402 aa  126  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  36.24 
 
 		 245 aa  125  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  42.68 
 
 		 490 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  40.59 
 
 		 684 aa  124  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  40.24 
 
 		 490 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  39.06 
 
 		 838 aa  122  4e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  38.89 
 
 		 2413 aa  121  9e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  34.29 
 
 		 172 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  39.02 
 
 		 961 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  43.15 
 
 		 185 aa  120  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  41.45 
 
 		 1493 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.52 
 
 		 346 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  32.97 
 
 		 344 aa  119  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  36.26 
 
 		 305 aa  118  9e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.23 
 
 		 528 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.95 
 
 		 1261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 223 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.6 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  34.9 
 
 		 373 aa  115  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  37.37 
 
 		 509 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  37.37 
 
 		 509 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  40.13 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.2 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  35.79 
 
 		 1877 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  37.91 
 
 		 464 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  37.37 
 
 		 509 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  37.37 
 
 		 509 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.11 
 
 		 225 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  40 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.43 
 
 		 343 aa  112  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  34.38 
 
 		 373 aa  112  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  37.43 
 
 		 416 aa  112  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 1032 aa  112  8.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  37.13 
 
 		 342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  38.12 
 
 		 331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  37.71 
 
 		 731 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  41.01 
 
 		 380 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  38.33 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  39.88 
 
 		 321 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  39.22 
 
 		 763 aa  108  5e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.56 
 
 		 382 aa  108  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  38.1 
 
 		 315 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  38.92 
 
 		 552 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  39.64 
 
 		 1002 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  39.6 
 
 		 329 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  30.37 
 
 		 293 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3402  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.98 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.98 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  40.88 
 
 		 368 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  44.9 
 
 		 1910 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  38.27 
 
 		 380 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  39.38 
 
 		 252 aa  107  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  38.64 
 
 		 415 aa  106  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.94 
 
 		 865 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.26 
 
 		 392 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.12 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  36.32 
 
 		 839 aa  106  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  39.16 
 
 		 346 aa  105  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.61 
 
 		 363 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.07 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  39.34 
 
 		 839 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  35.83 
 
 		 1430 aa  105  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  38.29 
 
 		 274 aa  105  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  36.96 
 
 		 482 aa  105  9e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  50.41 
 
 		 399 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0024  putative signal peptide protein  39.89 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0407866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.43 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.63 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  38.99 
 
 		 193 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  36.16 
 
 		 331 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  36.16 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  36.16 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.46 
 
 		 1110 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1108  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.77 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633913  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  35.75 
 
 		 976 aa  102  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>