More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4473 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  100 
 
 		 366 aa  726    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  82.07 
 
 		 367 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  78.32 
 
 		 363 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  65.15 
 
 		 368 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  63.1 
 
 		 357 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  62.57 
 
 		 346 aa  432  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  64.05 
 
 		 368 aa  398  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0312  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.09 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  46.67 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3521  Sel1 domain-containing protein  36.93 
 
 		 387 aa  212  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.894704  normal  0.280761 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  45.29 
 
 		 321 aa  199  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2371  Sel1 domain-containing protein  41.3 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  46.24 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00795685  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2648  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40 
 
 		 347 aa  193  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0668923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.28 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0154  Sel1 domain-containing protein  40.88 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0876617 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.44 
 
 		 360 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3674  enhanced entry protein  36.33 
 
 		 540 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3567  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.58 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2666  Sel1 domain-containing protein  32.73 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0163222  normal  0.379262 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.72 
 
 		 528 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  34.56 
 
 		 1402 aa  125  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  34.65 
 
 		 684 aa  124  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  32.19 
 
 		 489 aa  122  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  34.62 
 
 		 831 aa  122  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  33.33 
 
 		 961 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.52 
 
 		 565 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  32.72 
 
 		 1493 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  32.19 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  30.92 
 
 		 789 aa  117  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  34.1 
 
 		 685 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  32.78 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  31.76 
 
 		 373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  33.91 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.39 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 		 1032 aa  112  8.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  32.42 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  29.1 
 
 		 1037 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  34.45 
 
 		 557 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0954  Sel1 domain-containing protein  33.46 
 
 		 478 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.683818  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  38.46 
 
 		 185 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  28.25 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  33.18 
 
 		 838 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  33.71 
 
 		 235 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  31.64 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.47 
 
 		 341 aa  106  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.17 
 
 		 270 aa  106  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  30.95 
 
 		 425 aa  106  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  31.8 
 
 		 380 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  29.51 
 
 		 256 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1002 aa  103  6e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  35.65 
 
 		 505 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  32.64 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.05 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  30.93 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 		 448 aa  100  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.27 
 
 		 811 aa  100  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.56 
 
 		 343 aa  99.4  8e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  28.57 
 
 		 490 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  28.57 
 
 		 490 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 		 303 aa  97.8  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 976 aa  97.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  31.54 
 
 		 348 aa  96.3  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  30.56 
 
 		 245 aa  95.9  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  35.56 
 
 		 255 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  31.88 
 
 		 1430 aa  94.4  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  28.51 
 
 		 679 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  31.9 
 
 		 680 aa  93.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  38.69 
 
 		 246 aa  93.2  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  26.95 
 
 		 305 aa  92.8  8e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  32.74 
 
 		 358 aa  92.8  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  28.99 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  31.47 
 
 		 350 aa  92.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  28.9 
 
 		 271 aa  91.7  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.53 
 
 		 890 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.04 
 
 		 512 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1708  hypothetical protein  29.72 
 
 		 362 aa  90.9  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  28.03 
 
 		 591 aa  90.9  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  31.96 
 
 		 359 aa  90.9  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1651  hypothetical protein  29.72 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.563504  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  28.44 
 
 		 2413 aa  90.5  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1877 aa  90.1  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.34 
 
 		 321 aa  90.1  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0178  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 679 aa  90.1  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  32.34 
 
 		 365 aa  89.7  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  28.16 
 
 		 254 aa  89.4  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  31.96 
 
 		 274 aa  89.4  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  33.64 
 
 		 464 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2103  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 357 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0952151  normal  0.0177116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.97 
 
 		 392 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  32.31 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.58 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.71 
 
 		 865 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30 
 
 		 272 aa  87  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.36 
 
 		 231 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.5 
 
 		 225 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  31.1 
 
 		 208 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  35.56 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  26.79 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>