More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1498 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 225 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  95.93 
 
 		 231 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  42.41 
 
 		 489 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  42.24 
 
 		 393 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  39.02 
 
 		 831 aa  121  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  42.95 
 
 		 557 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  32.51 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  45.1 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  40.76 
 
 		 1402 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  40.76 
 
 		 684 aa  116  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  39.47 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  38.16 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  36.81 
 
 		 373 aa  112  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  38.82 
 
 		 425 aa  112  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  41.4 
 
 		 245 aa  111  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  36.2 
 
 		 373 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  36.9 
 
 		 789 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  36.57 
 
 		 685 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.39 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  37.89 
 
 		 961 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  35.83 
 
 		 303 aa  109  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  35.76 
 
 		 448 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  38.8 
 
 		 976 aa  108  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  108  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  36.94 
 
 		 490 aa  108  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  34.81 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  41.29 
 
 		 416 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  36.94 
 
 		 185 aa  106  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  36.31 
 
 		 490 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  37.35 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  34.1 
 
 		 1037 aa  104  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  37.82 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.58 
 
 		 318 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  34.73 
 
 		 1493 aa  103  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  38.22 
 
 		 1032 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.67 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.88 
 
 		 341 aa  102  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  35.85 
 
 		 329 aa  102  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  33.89 
 
 		 254 aa  101  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  35.12 
 
 		 376 aa  101  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.33 
 
 		 325 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.7 
 
 		 392 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.29 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  35.33 
 
 		 325 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  35.12 
 
 		 376 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  35.93 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.11 
 
 		 528 aa  99.8  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  36.5 
 
 		 368 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.08 
 
 		 222 aa  99.4  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  41.46 
 
 		 274 aa  98.6  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  34.73 
 
 		 285 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  39.74 
 
 		 315 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  36.48 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  37.26 
 
 		 359 aa  97.1  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  45.51 
 
 		 591 aa  97.1  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.73 
 
 		 380 aa  97.1  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.58 
 
 		 321 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0954  Sel1 domain-containing protein  35.03 
 
 		 478 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.683818  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  34.55 
 
 		 271 aa  96.3  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  34.13 
 
 		 327 aa  95.9  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  35.52 
 
 		 464 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  38.65 
 
 		 367 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  36.88 
 
 		 509 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  36.88 
 
 		 509 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.29 
 
 		 270 aa  94.7  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  30.58 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.96 
 
 		 272 aa  94.4  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  29.27 
 
 		 293 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  31.89 
 
 		 1877 aa  94.7  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  28.93 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.41 
 
 		 2413 aa  94  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  36.88 
 
 		 509 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1606  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.51 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.566545  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  36.88 
 
 		 509 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  32.92 
 
 		 838 aa  93.6  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  31.43 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  39.38 
 
 		 1059 aa  92.8  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  31.31 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  32.94 
 
 		 348 aa  92.8  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 		 252 aa  92.8  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  32.93 
 
 		 552 aa  92.4  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.53 
 
 		 1012 aa  92.4  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.24 
 
 		 316 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  40.61 
 
 		 358 aa  91.7  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  32.95 
 
 		 331 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  38.82 
 
 		 1105 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.27 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0448  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.41 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.153887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.73 
 
 		 163 aa  91.3  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  32.95 
 
 		 331 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  38.16 
 
 		 1134 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  40.3 
 
 		 679 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.42 
 
 		 1261 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  32.95 
 
 		 331 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.1 
 
 		 346 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  32.28 
 
 		 1002 aa  90.5  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  43.92 
 
 		 321 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  44.78 
 
 		 380 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  38.16 
 
 		 1086 aa  89.4  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>