More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2705 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  100 
 
 
241 aa  495  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  38.54 
 
 
246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  50.3 
 
 
831 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  48.8 
 
 
684 aa  160  1e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  49.4 
 
 
425 aa  158  6e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  46.59 
 
 
393 aa  158  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  42.7 
 
 
489 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  42.33 
 
 
235 aa  155  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  41.87 
 
 
557 aa  150  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  46.11 
 
 
961 aa  150  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  46.01 
 
 
1402 aa  149  3e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  48.45 
 
 
1493 aa  149  5e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.34 
 
 
318 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  50.34 
 
 
2413 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  47.71 
 
 
789 aa  144  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  42.77 
 
 
448 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  45.16 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  39.52 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  39.53 
 
 
267 aa  137  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  43.01 
 
 
254 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  45.34 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.38 
 
 
343 aa  134  9e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  42.86 
 
 
1037 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.64 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.86 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  38.42 
 
 
416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 
252 aa  133  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  40.84 
 
 
490 aa  132  6e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  40.72 
 
 
685 aa  132  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  44.59 
 
 
232 aa  131  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  45.1 
 
 
976 aa  131  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  40.72 
 
 
490 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  38.86 
 
 
376 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  36.95 
 
 
223 aa  129  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.93 
 
 
1012 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  43.37 
 
 
271 aa  129  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  37.77 
 
 
376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  40.37 
 
 
305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  37.37 
 
 
303 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  38.29 
 
 
1032 aa  128  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.71 
 
 
255 aa  126  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  41.72 
 
 
380 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  34.53 
 
 
373 aa  126  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  34.07 
 
 
329 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  36.95 
 
 
342 aa  125  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  42.48 
 
 
838 aa  124  9e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  43.62 
 
 
1877 aa  124  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.83 
 
 
346 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  44.37 
 
 
185 aa  123  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  39.53 
 
 
850 aa  123  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.41 
 
 
222 aa  123  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  39.13 
 
 
359 aa  123  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.51 
 
 
528 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  37.84 
 
 
293 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0432  hypothetical protein  36.22 
 
 
246 aa  122  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  40.51 
 
 
218 aa  122  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  35.96 
 
 
344 aa  122  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  33.78 
 
 
373 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  36.26 
 
 
1059 aa  122  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  38.2 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.68 
 
 
231 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  36.84 
 
 
509 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  39.16 
 
 
172 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.68 
 
 
225 aa  119  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  41.67 
 
 
731 aa  120  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  36.84 
 
 
509 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  38.82 
 
 
331 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  36.84 
 
 
509 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.14 
 
 
1110 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  36.84 
 
 
509 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.58 
 
 
380 aa  117  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  38.96 
 
 
839 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0510  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.633688  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.94 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  34.57 
 
 
1086 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.52 
 
 
1261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  39.24 
 
 
276 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.6 
 
 
321 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  36.51 
 
 
380 aa  115  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.76 
 
 
392 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  39.76 
 
 
1002 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  36.36 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  31.92 
 
 
358 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  37.21 
 
 
552 aa  113  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  41.83 
 
 
763 aa  113  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  41.56 
 
 
193 aa  113  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  35.15 
 
 
315 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  38.76 
 
 
1430 aa  112  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.88 
 
 
211 aa  112  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  39.26 
 
 
464 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  43.38 
 
 
274 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.41 
 
 
1263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  36.99 
 
 
482 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  38.46 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.71 
 
 
321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  33.68 
 
 
1081 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  38.71 
 
 
365 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  38.55 
 
 
839 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  44.81 
 
 
304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>