More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0153 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 181 aa  365  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  55.09 
 
 		 223 aa  226  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  50.4 
 
 		 252 aa  219  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  49.29 
 
 		 831 aa  142  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  54.76 
 
 		 1493 aa  130  7.999999999999999e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  41.67 
 
 		 489 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  50 
 
 		 684 aa  127  8.000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  53.97 
 
 		 557 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  53.17 
 
 		 448 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  46.98 
 
 		 318 aa  124  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  46.53 
 
 		 425 aa  124  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  46.81 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  49.59 
 
 		 1402 aa  122  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  43.21 
 
 		 490 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.64 
 
 		 343 aa  122  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  55.37 
 
 		 267 aa  121  6e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  45.99 
 
 		 185 aa  120  9e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  41.98 
 
 		 490 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  48.82 
 
 		 235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  47.62 
 
 		 789 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  47.83 
 
 		 2413 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  50.36 
 
 		 256 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  47.62 
 
 		 208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  50 
 
 		 232 aa  117  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.14 
 
 		 341 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  44.19 
 
 		 393 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  51.28 
 
 		 416 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  44.44 
 
 		 961 aa  114  6e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  54.62 
 
 		 346 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  47.66 
 
 		 342 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  48.41 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  55.88 
 
 		 117 aa  112  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  41.55 
 
 		 305 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  48.84 
 
 		 552 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  42.03 
 
 		 271 aa  111  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  48.33 
 
 		 255 aa  111  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  40.99 
 
 		 365 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  40 
 
 		 241 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  43.36 
 
 		 685 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.5 
 
 		 528 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  47.54 
 
 		 731 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  46.83 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  45.32 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  37.11 
 
 		 172 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  42.65 
 
 		 1032 aa  106  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  37.95 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  44.03 
 
 		 376 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  42.65 
 
 		 303 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  40.56 
 
 		 586 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  43.94 
 
 		 329 aa  105  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  44.12 
 
 		 376 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  40.29 
 
 		 359 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  48.74 
 
 		 380 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  42.19 
 
 		 509 aa  104  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  42.19 
 
 		 509 aa  104  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  44.44 
 
 		 373 aa  104  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  42.19 
 
 		 509 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  42.19 
 
 		 509 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.55 
 
 		 392 aa  104  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  44.35 
 
 		 373 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.69 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  44.63 
 
 		 763 aa  103  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  37.76 
 
 		 1037 aa  103  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.44 
 
 		 278 aa  102  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0788  Sel1 domain-containing protein  37.5 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191842 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  44.14 
 
 		 976 aa  101  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  42.11 
 
 		 838 aa  101  6e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.55 
 
 		 325 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.27 
 
 		 380 aa  100  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  43.55 
 
 		 325 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  38.41 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.68 
 
 		 1110 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  42.74 
 
 		 260 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  43.55 
 
 		 1877 aa  99.4  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  44.44 
 
 		 1002 aa  100  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  49.59 
 
 		 839 aa  99.4  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  38.4 
 
 		 1059 aa  98.6  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  40.3 
 
 		 304 aa  98.6  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  41.26 
 
 		 202 aa  98.2  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  37.6 
 
 		 1086 aa  98.2  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  40.83 
 
 		 1160 aa  97.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  41.18 
 
 		 331 aa  97.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  42.61 
 
 		 1430 aa  97.8  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  41.6 
 
 		 380 aa  97.4  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  42.74 
 
 		 285 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  40.14 
 
 		 464 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  38.76 
 
 		 246 aa  96.3  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  42.74 
 
 		 325 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  35.29 
 
 		 331 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  35.29 
 
 		 331 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  35.29 
 
 		 331 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  44.14 
 
 		 294 aa  95.5  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  41.94 
 
 		 327 aa  95.5  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.14 
 
 		 294 aa  95.5  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  40.17 
 
 		 276 aa  95.5  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.88 
 
 		 282 aa  95.5  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.34 
 
 		 163 aa  95.5  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  38.24 
 
 		 839 aa  95.1  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.39 
 
 		 321 aa  94.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>