More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1430 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1430  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 
942 aa  1884    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.356598 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  30.36 
 
 
817 aa  145  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  42.14 
 
 
961 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  41.03 
 
 
232 aa  115  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  41.56 
 
 
789 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  40.13 
 
 
831 aa  113  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  39.62 
 
 
684 aa  112  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  39.88 
 
 
1402 aa  109  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  40.76 
 
 
448 aa  102  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  38.03 
 
 
838 aa  102  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  40.98 
 
 
1002 aa  101  6e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  39.26 
 
 
416 aa  100  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  32.81 
 
 
376 aa  100  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  40.4 
 
 
489 aa  99.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  37.97 
 
 
235 aa  99.4  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  40.25 
 
 
505 aa  99  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  35.33 
 
 
267 aa  98.2  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  42.74 
 
 
256 aa  98.2  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  36.31 
 
 
376 aa  98.2  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.89 
 
 
346 aa  97.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  34.18 
 
 
1493 aa  97.4  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 
303 aa  96.3  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  36.88 
 
 
1037 aa  95.9  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  37.58 
 
 
2413 aa  95.9  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.46 
 
 
318 aa  95.1  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  33.13 
 
 
329 aa  94.7  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.43 
 
 
222 aa  93.6  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  33.12 
 
 
264 aa  92.4  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.41 
 
 
341 aa  91.7  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  36.31 
 
 
393 aa  92  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  32.47 
 
 
1877 aa  91.7  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  42.59 
 
 
117 aa  91.7  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  36.55 
 
 
185 aa  91.3  8e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.39 
 
 
278 aa  89.7  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  34.42 
 
 
255 aa  89.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  36.18 
 
 
557 aa  89.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  41.91 
 
 
490 aa  89  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  41.91 
 
 
490 aa  89  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  39.49 
 
 
252 aa  88.6  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  37.01 
 
 
373 aa  88.2  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  33.12 
 
 
271 aa  88.2  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  35.62 
 
 
373 aa  87.4  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.81 
 
 
1263 aa  86.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  35.43 
 
 
233 aa  86.3  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  33.99 
 
 
425 aa  85.5  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  31.85 
 
 
731 aa  84.7  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  39.29 
 
 
410 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  31.93 
 
 
241 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  36.67 
 
 
685 aa  84.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.97 
 
 
231 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  35.46 
 
 
223 aa  84  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  36.3 
 
 
208 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  28.71 
 
 
274 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  34.19 
 
 
245 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.08 
 
 
380 aa  82.8  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  30.9 
 
 
342 aa  82.8  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  35.14 
 
 
978 aa  82.8  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
1032 aa  82.4  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  39.53 
 
 
358 aa  82  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.16 
 
 
343 aa  82  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.81 
 
 
1260 aa  81.6  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.69 
 
 
1261 aa  81.3  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  32.53 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  35.37 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  34.09 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  35.57 
 
 
305 aa  80.9  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  35.04 
 
 
172 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.69 
 
 
528 aa  80.1  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  34.27 
 
 
380 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  34.53 
 
 
679 aa  79.3  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.68 
 
 
1012 aa  79.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  35.51 
 
 
246 aa  79.3  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  32.73 
 
 
344 aa  79.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  31.91 
 
 
293 aa  79  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  34.23 
 
 
509 aa  79  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  34.23 
 
 
509 aa  79  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.77 
 
 
865 aa  79  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 
193 aa  78.6  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  34.23 
 
 
509 aa  78.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  34.23 
 
 
509 aa  78.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  35.57 
 
 
976 aa  78.6  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  34 
 
 
850 aa  78.6  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  33.77 
 
 
552 aa  78.2  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  31.54 
 
 
218 aa  78.2  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  31.91 
 
 
1059 aa  78.2  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  32.35 
 
 
254 aa  77  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  35.94 
 
 
961 aa  77  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.6 
 
 
392 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.74 
 
 
225 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1532  Sel1 domain-containing protein  31.65 
 
 
746 aa  76.6  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00292625  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  34.23 
 
 
680 aa  76.3  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  37.72 
 
 
1910 aa  76.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  33.93 
 
 
763 aa  76.3  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  33.33 
 
 
365 aa  75.5  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1775  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.11 
 
 
267 aa  75.5  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.43 
 
 
890 aa  75.1  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  36.24 
 
 
464 aa  75.1  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.62 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  36.43 
 
 
591 aa  74.7  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>