More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1775 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1775  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 267 aa  541  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  38.83 
 
 		 684 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  38.74 
 
 		 789 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  39.01 
 
 		 489 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  39.47 
 
 		 416 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  38.31 
 
 		 1402 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  36.54 
 
 		 831 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.11 
 
 		 346 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  36.11 
 
 		 838 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 252 aa  116  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  35.08 
 
 		 961 aa  115  6e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  41.94 
 
 		 185 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  35.26 
 
 		 393 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  31.86 
 
 		 448 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  36.56 
 
 		 1493 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  37.69 
 
 		 255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.33 
 
 		 318 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  39.44 
 
 		 1032 aa  112  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  37.16 
 
 		 557 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.19 
 
 		 380 aa  111  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  35.05 
 
 		 1877 aa  110  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  36.06 
 
 		 685 aa  109  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  34.43 
 
 		 305 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  37.32 
 
 		 2413 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  35.52 
 
 		 235 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  34.13 
 
 		 1037 aa  107  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  33.78 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  34.22 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  30.83 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  31.2 
 
 		 490 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  31.47 
 
 		 490 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  38.33 
 
 		 425 aa  106  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  37.31 
 
 		 509 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  34.05 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  37.89 
 
 		 509 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  35.8 
 
 		 208 aa  104  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  36.28 
 
 		 509 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  38.92 
 
 		 1910 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  37.89 
 
 		 509 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.7 
 
 		 528 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  34.27 
 
 		 376 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  34.27 
 
 		 376 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  34.59 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1002 aa  101  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  34.44 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3521  Sel1 domain-containing protein  36.51 
 
 		 387 aa  99  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.894704  normal  0.280761 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  32.42 
 
 		 254 aa  98.6  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  36.11 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  30.4 
 
 		 373 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.03 
 
 		 341 aa  98.2  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  34.97 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  35.02 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.89 
 
 		 278 aa  95.9  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  29.96 
 
 		 373 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  34.05 
 
 		 482 aa  94.7  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  35.71 
 
 		 246 aa  92.8  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  36.62 
 
 		 193 aa  92.4  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0312  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.41 
 
 		 322 aa  92  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  34.1 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  32.16 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  31.84 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.02 
 
 		 865 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  31.98 
 
 		 763 aa  91.3  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  37.06 
 
 		 552 aa  90.1  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 976 aa  90.5  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  35.67 
 
 		 850 aa  88.6  9e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  26.48 
 
 		 348 aa  88.2  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.46 
 
 		 222 aa  87.8  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  33.16 
 
 		 839 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.66 
 
 		 343 aa  87  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  28.25 
 
 		 523 aa  86.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.36 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  30.49 
 
 		 1430 aa  86.3  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2103  Sel1 domain-containing protein  38.65 
 
 		 357 aa  85.9  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0952151  normal  0.0177116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.96 
 
 		 392 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 223 aa  85.9  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  36.79 
 
 		 399 aa  85.5  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  34.52 
 
 		 720 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.28 
 
 		 1196 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  34.52 
 
 		 720 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  37.96 
 
 		 731 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  35.75 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  26.61 
 
 		 839 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1532  Sel1 domain-containing protein  31.49 
 
 		 746 aa  84.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00292625  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  37.42 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  34.3 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  32.24 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  39.57 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  33.93 
 
 		 720 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 1012 aa  82.8  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  32.82 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  33.01 
 
 		 1059 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.71 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  32.82 
 
 		 679 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0241  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30 
 
 		 480 aa  82.8  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.381439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  33.93 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  33.66 
 
 		 464 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  29.25 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  31.19 
 
 		 1086 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>