More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3235 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  100 
 
 		 839 aa  1719    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1144  stage V sporulation protein K  44.13 
 
 		 1930 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  45.75 
 
 		 855 aa  414  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1988  ATPase central domain-containing protein  42.64 
 
 		 664 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.204493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1455  ATPase central domain-containing protein  43.09 
 
 		 653 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.183766  hitchhiker  0.0000524636 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4249  AAA ATPase, central region  41.53 
 
 		 846 aa  385  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1627  AAA ATPase central domain protein  42.16 
 
 		 1110 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.856063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7100  ATPase central domain-containing protein  40.68 
 
 		 780 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2403  AAA ATPase central domain-containing protein  41.55 
 
 		 779 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1592  AAA ATPase central domain protein  41.31 
 
 		 819 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00365213  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2144  ATPase  41.92 
 
 		 802 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844898  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0170  stage V sporulation protein K  39.81 
 
 		 550 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.129019  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3318  AAA ATPase central domain protein  40.07 
 
 		 823 aa  357  5e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.488425  normal  0.919341 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1517  spoVK domain-containing protein  35.62 
 
 		 1133 aa  332  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.885165  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4841  ATPase central domain-containing protein  36.59 
 
 		 1105 aa  259  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585558  hitchhiker  0.0091693 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1312  AAA ATPase central domain protein  49.42 
 
 		 389 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1283  AAA ATPase central domain protein  43.93 
 
 		 389 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3309  AAA ATPase central domain protein  46.74 
 
 		 617 aa  253  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0029  AAA+ class-like ATPase  49.22 
 
 		 469 aa  243  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.509013  hitchhiker  0.00474583 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17420  AAA+ family ATPase  48.84 
 
 		 466 aa  238  4e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.131578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2862  AAA ATPase central domain protein  48.33 
 
 		 379 aa  233  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3584  AAA ATPase central domain protein  47.49 
 
 		 678 aa  231  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.883196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1396  AAA ATPase central domain protein  48.33 
 
 		 341 aa  231  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2067  ATPases of the AAA+ class-like protein  44.19 
 
 		 365 aa  231  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3526  AAA ATPase central domain protein  48.33 
 
 		 341 aa  231  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1867  ATPase central domain-containing protein  48.12 
 
 		 344 aa  228  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0460326  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0226  AAA ATPase central domain protein  48.69 
 
 		 344 aa  228  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1502  AAA ATPase central domain protein  45.31 
 
 		 321 aa  228  4e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000852955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3060  AAA ATPase central domain protein  46.15 
 
 		 541 aa  226  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283109 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1619  ATPase central domain-containing protein  44.28 
 
 		 298 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.684878  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11610  AAA ATPase central domain protein  42.25 
 
 		 348 aa  222  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1566  AAA ATPase central domain protein  46.83 
 
 		 329 aa  219  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.201221  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6840  ATPase central domain-containing protein  49.45 
 
 		 354 aa  219  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0673  AAA ATPase, central region  40.82 
 
 		 487 aa  218  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.265099 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4241  AAA ATPase, central region  43.84 
 
 		 390 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.434554  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2104  stage V sporulation protein K  43.13 
 
 		 310 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2725  AAA ATPase central domain protein  43.19 
 
 		 321 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00914326  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0983  hypothetical protein  44.53 
 
 		 299 aa  213  9e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00278176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4389  ATPase central domain-containing protein  43.03 
 
 		 466 aa  213  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1224  stage V sporulation protein K  39.59 
 
 		 310 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000254018  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1118  AAA ATPase  42.91 
 
 		 331 aa  210  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000607625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1880  ATPase central domain-containing protein  39.85 
 
 		 318 aa  209  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00868854  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1496  stage V sporulation protein K  40.91 
 
 		 318 aa  208  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0780968  normal  0.0751264 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3809  stage V sporulation protein K  40.56 
 
 		 318 aa  207  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0467  ATPase central domain-containing protein  45.26 
 
 		 564 aa  207  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.12935 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2132  AAA ATPase central domain protein  39.04 
 
 		 322 aa  207  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.474775  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3475  sporulation stage V protein K  40.56 
 
 		 318 aa  207  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0352307  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  33.05 
 
 		 2310 aa  207  9e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3719  stage V sporulation protein K  40.56 
 
 		 318 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0200700000000003e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3555  stage V sporulation protein K  40.56 
 
 		 318 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3454  stage V sporulation protein K  40.56 
 
 		 318 aa  206  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3760  stage V sporulation protein K  40.56 
 
 		 318 aa  207  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3839  stage V sporulation protein K  40.56 
 
 		 318 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3737  stage V sporulation protein K  40.56 
 
 		 318 aa  206  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3467  stage V sporulation protein K  40.56 
 
 		 318 aa  206  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0329  ATPase central domain-containing protein  43.19 
 
 		 616 aa  204  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2387  sporulation stage V protein K  41.85 
 
 		 318 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0379773  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1454  ATPase central domain-containing protein  43.26 
 
 		 366 aa  202  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000393055 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0394  AAA ATPase central domain protein  49.78 
 
 		 558 aa  202  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0521615  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12600  AAA+ family ATPase  46.77 
 
 		 681 aa  201  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.37602  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1071  ATPase central domain-containing protein  44.62 
 
 		 596 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2784  AAA type ATPase  42.48 
 
 		 298 aa  197  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0684  AAA ATPase, central region  40.97 
 
 		 320 aa  197  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10289  hypothetical protein  43.05 
 
 		 631 aa  196  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000685477  normal  0.631153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1749  CbbX protein  42.18 
 
 		 308 aa  193  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3030  CbbX protein  41.76 
 
 		 310 aa  193  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00687874  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3720  AAA ATPase, central region  42.8 
 
 		 307 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.220422  hitchhiker  0.00179613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0411  ATPase central domain-containing protein  42.03 
 
 		 615 aa  193  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448945 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2710  ATPase central domain-containing protein  40.21 
 
 		 309 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.947167 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3253  phosphoribulokinase/uridine kinase  39.65 
 
 		 312 aa  191  7e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4051  AAA ATPase, central region  41.31 
 
 		 304 aa  190  9e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3749  AAA ATPase, central region  41.31 
 
 		 304 aa  190  9e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225379  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1280  CbbX protein  41.7 
 
 		 341 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1329  AAA ATPase, central region  41.54 
 
 		 306 aa  190  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0370  AAA ATPase, central region  39.13 
 
 		 594 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0359  ATPase central domain-containing protein  39.13 
 
 		 594 aa  190  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0702866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0380  ATPase central domain-containing protein  39.13 
 
 		 594 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0453  CbbX-like protein  42.86 
 
 		 334 aa  189  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6495  CbbX protein  42.91 
 
 		 329 aa  188  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0331  AAA ATPase  38.81 
 
 		 320 aa  188  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000626535  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2939  ATPase central domain-containing protein  41.3 
 
 		 309 aa  188  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.949786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6395  CbbX-like protein  41.7 
 
 		 310 aa  187  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0826  ATPase central domain-containing protein  40.46 
 
 		 306 aa  187  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1480  AAA type ATPase  39.78 
 
 		 318 aa  187  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2927  CbbX like protein  40.75 
 
 		 304 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3962  AAA ATPase-like  42.07 
 
 		 306 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157351 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13903  hypothetical protein  41.18 
 
 		 573 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5503  ATPase central domain-containing protein  40.8 
 
 		 593 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0936  AAA ATPase central domain protein  53.85 
 
 		 591 aa  185  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.522064  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3926  CbxX/CfqX monofunctional  40.93 
 
 		 311 aa  185  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  47.17 
 
 		 831 aa  185  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1701  ATPase central domain-containing protein  39.93 
 
 		 308 aa  184  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2451  CbbX-like protein, putative AAA ATPase  42.64 
 
 		 349 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.349953 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1197  CbbX protein  41.18 
 
 		 307 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08171  RuBisCo-expression protein CbbX  41.18 
 
 		 305 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0763  ATPase  41.03 
 
 		 301 aa  180  9e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  46.58 
 
 		 489 aa  178  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  45.37 
 
 		 1402 aa  177  5e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1916  CbxX/CfqX monofunctional  41.6 
 
 		 317 aa  178  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.931527 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  42.61 
 
 		 789 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>