More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3521 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3521  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 
387 aa  788    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.894704  normal  0.280761 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0312  Sel1 domain protein repeat-containing protein  65.05 
 
 
322 aa  368  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2648  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.35 
 
 
347 aa  237  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0668923  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.1 
 
 
382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2371  Sel1 domain-containing protein  47 
 
 
372 aa  233  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0154  Sel1 domain-containing protein  48.18 
 
 
350 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0876617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.55 
 
 
319 aa  222  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00795685  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  41.12 
 
 
368 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  40.48 
 
 
357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.57 
 
 
363 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  43.48 
 
 
367 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  42.81 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  46.21 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  41.88 
 
 
366 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  45.64 
 
 
384 aa  202  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  39.01 
 
 
368 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.43 
 
 
360 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2666  Sel1 domain-containing protein  39.35 
 
 
381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0163222  normal  0.379262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3567  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.09 
 
 
360 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  38.28 
 
 
393 aa  146  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3674  enhanced entry protein  37.72 
 
 
540 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  35.63 
 
 
961 aa  142  9e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  36.44 
 
 
1402 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  35.45 
 
 
337 aa  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  37.8 
 
 
831 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  35.45 
 
 
684 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  35.34 
 
 
373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  35.62 
 
 
789 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  35.34 
 
 
373 aa  129  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.4 
 
 
528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  36.53 
 
 
489 aa  125  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  34.5 
 
 
425 aa  122  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  36.67 
 
 
557 aa  122  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  35.32 
 
 
305 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.21 
 
 
341 aa  119  9e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  35.89 
 
 
416 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.49 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  38.65 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  33.96 
 
 
685 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1651  hypothetical protein  32.76 
 
 
362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.563504  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1708  hypothetical protein  32.76 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  35.89 
 
 
303 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  31.74 
 
 
1037 aa  114  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.18 
 
 
448 aa  113  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  37.76 
 
 
464 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  34.47 
 
 
1032 aa  112  8.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  30.58 
 
 
838 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  30.15 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.33 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.67 
 
 
890 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  29.78 
 
 
376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.64 
 
 
380 aa  110  5e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  38.3 
 
 
255 aa  109  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  35 
 
 
1002 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  31.74 
 
 
350 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  32.41 
 
 
256 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.95 
 
 
392 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  39.15 
 
 
380 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  32.16 
 
 
1493 aa  107  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  35.07 
 
 
271 aa  107  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  32.93 
 
 
679 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  33.71 
 
 
359 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  30.04 
 
 
329 aa  106  9e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.47 
 
 
316 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  37.14 
 
 
358 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 
976 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  32.66 
 
 
2413 aa  103  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  33.02 
 
 
342 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  38.42 
 
 
274 aa  103  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  32.77 
 
 
680 aa  103  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  33.66 
 
 
1877 aa  102  8e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  34.78 
 
 
490 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  33.63 
 
 
245 aa  100  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  31.82 
 
 
235 aa  99.8  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  33.04 
 
 
482 aa  99  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1775  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.51 
 
 
267 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  34.08 
 
 
232 aa  99  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  28.32 
 
 
490 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  30.38 
 
 
267 aa  97.4  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  39.77 
 
 
1910 aa  96.7  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  30.84 
 
 
348 aa  96.7  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  27.53 
 
 
264 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 
252 aa  95.9  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.6 
 
 
270 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.27 
 
 
343 aa  94.7  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  34.01 
 
 
399 aa  94  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1108  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.86 
 
 
342 aa  93.6  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633913  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  31.4 
 
 
315 aa  92.8  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.29 
 
 
512 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.53 
 
 
278 aa  92.4  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  31.05 
 
 
365 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.03 
 
 
325 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.05 
 
 
321 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  32.03 
 
 
325 aa  92  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  34.3 
 
 
1430 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  40.62 
 
 
202 aa  90.9  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  36.73 
 
 
1059 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  32.04 
 
 
208 aa  91.3  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  31.9 
 
 
971 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  28.32 
 
 
331 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>