More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3674 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3674  enhanced entry protein  100 
 
 		 540 aa  1079    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3567  Sel1 domain protein repeat-containing protein  67.6 
 
 		 360 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  67.29 
 
 		 360 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2666  Sel1 domain-containing protein  62.03 
 
 		 381 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0163222  normal  0.379262 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1651  hypothetical protein  49.31 
 
 		 362 aa  268  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.563504  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1708  hypothetical protein  49.31 
 
 		 362 aa  267  4e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  48.96 
 
 		 350 aa  265  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  50 
 
 		 337 aa  259  7e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  34.93 
 
 		 368 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3521  Sel1 domain-containing protein  37.72 
 
 		 387 aa  146  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.894704  normal  0.280761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.73 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  34.9 
 
 		 384 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0312  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.11 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  35.86 
 
 		 368 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  35.54 
 
 		 357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  36.26 
 
 		 367 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  36.33 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.99 
 
 		 382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  37.7 
 
 		 346 aa  133  9e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2648  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.05 
 
 		 347 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0668923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2371  Sel1 domain-containing protein  39.33 
 
 		 372 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.43 
 
 		 319 aa  120  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00795685  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0154  Sel1 domain-containing protein  32.89 
 
 		 350 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0876617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  35.59 
 
 		 321 aa  114  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0156  hypothetical protein  32.65 
 
 		 365 aa  114  5e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.74 
 
 		 684 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  35.04 
 
 		 393 aa  110  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  32.63 
 
 		 1402 aa  110  8.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  34.04 
 
 		 831 aa  107  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  29.93 
 
 		 685 aa  107  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  31.31 
 
 		 305 aa  106  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  30.33 
 
 		 557 aa  105  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  30.38 
 
 		 789 aa  103  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.49 
 
 		 380 aa  102  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.73 
 
 		 593 aa  102  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  31.17 
 
 		 448 aa  100  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  31.22 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1037 aa  100  6e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  33.48 
 
 		 416 aa  100  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  30.8 
 
 		 376 aa  99.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.91 
 
 		 318 aa  99  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 1032 aa  97.4  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  28.89 
 
 		 961 aa  96.7  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  29.49 
 
 		 489 aa  95.5  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 303 aa  94  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  28.96 
 
 		 1430 aa  93.6  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  31.78 
 
 		 490 aa  93.2  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1493 aa  91.7  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1877 aa  91.7  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  30.77 
 
 		 256 aa  90.9  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  30.28 
 
 		 838 aa  90.5  7e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  33.01 
 
 		 2413 aa  89.7  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  31.14 
 
 		 425 aa  89.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  30.84 
 
 		 490 aa  87.4  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  30.92 
 
 		 380 aa  87.4  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.04 
 
 		 346 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  29.2 
 
 		 415 aa  86.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  32.26 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  33.18 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  33.18 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  32 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  31.44 
 
 		 373 aa  83.2  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.46 
 
 		 343 aa  83.2  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  33.52 
 
 		 208 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  28.99 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  27.59 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  32.97 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 976 aa  80.9  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  29.73 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.32 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.56 
 
 		 528 aa  80.1  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  26.89 
 
 		 373 aa  79.7  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1002 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  30.17 
 
 		 961 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  31.55 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.53 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  31.53 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  27.6 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  26.49 
 
 		 680 aa  77  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  26.79 
 
 		 523 aa  76.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  34.29 
 
 		 850 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  28.4 
 
 		 358 aa  76.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.13 
 
 		 270 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  30.52 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  32.02 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  29.08 
 
 		 505 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.34 
 
 		 1263 aa  73.6  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  30.24 
 
 		 254 aa  73.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  31.08 
 
 		 285 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  28.31 
 
 		 380 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30 
 
 		 321 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  32.48 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.39 
 
 		 811 aa  70.9  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.32 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  27.57 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  28.46 
 
 		 1200 aa  70.5  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  29.03 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  28.46 
 
 		 1200 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.49 
 
 		 278 aa  69.7  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  30.84 
 
 		 679 aa  69.7  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>