More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7281 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 319 aa  625  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00795685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  85.28 
 
 		 321 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  62.88 
 
 		 382 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2648  Sel1 domain protein repeat-containing protein  68.46 
 
 		 347 aa  362  6e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0668923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2371  Sel1 domain-containing protein  68.1 
 
 		 372 aa  358  8e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0154  Sel1 domain-containing protein  65.2 
 
 		 350 aa  353  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0876617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3521  Sel1 domain-containing protein  44.55 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.894704  normal  0.280761 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0312  Sel1 domain protein repeat-containing protein  48.55 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  47.16 
 
 		 368 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  48.35 
 
 		 346 aa  225  6e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  46.89 
 
 		 363 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  45.14 
 
 		 357 aa  223  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  46.07 
 
 		 367 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  46.24 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  47.52 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  44 
 
 		 368 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  37.86 
 
 		 416 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  39.01 
 
 		 1402 aa  153  4e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  37.66 
 
 		 961 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  37.18 
 
 		 831 aa  152  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  36.08 
 
 		 684 aa  151  1e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.84 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.64 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3567  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.31 
 
 		 360 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  33.57 
 
 		 789 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  37.79 
 
 		 685 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  38.18 
 
 		 489 aa  138  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  35.93 
 
 		 425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3674  enhanced entry protein  36.36 
 
 		 540 aa  135  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  41.71 
 
 		 255 aa  135  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  34.04 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.41 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  35.93 
 
 		 557 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.37 
 
 		 528 aa  133  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  34.7 
 
 		 393 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 1032 aa  129  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  31.6 
 
 		 376 aa  129  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  32.22 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  32.07 
 
 		 1037 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  38.73 
 
 		 464 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  34.11 
 
 		 838 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1651  hypothetical protein  33.33 
 
 		 362 aa  125  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.563504  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  29.05 
 
 		 490 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1708  hypothetical protein  33.33 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  36.55 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.32 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  35 
 
 		 1493 aa  124  3e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2666  Sel1 domain-containing protein  34.3 
 
 		 381 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0163222  normal  0.379262 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  28.72 
 
 		 490 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  36.68 
 
 		 1002 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.24 
 
 		 346 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  31.52 
 
 		 373 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.98 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  34.19 
 
 		 342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  32.14 
 
 		 329 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 976 aa  118  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  32.99 
 
 		 350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  35 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  37.1 
 
 		 232 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  31.52 
 
 		 373 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  28.69 
 
 		 235 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  36.72 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  37.96 
 
 		 358 aa  112  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.14 
 
 		 392 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.88 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.16 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  31.48 
 
 		 256 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  36.19 
 
 		 679 aa  110  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  32.27 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  33.78 
 
 		 245 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.29 
 
 		 512 aa  110  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  38.5 
 
 		 315 aa  109  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  34.16 
 
 		 415 aa  109  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.5 
 
 		 272 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  40.48 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  35 
 
 		 482 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  35.58 
 
 		 185 aa  108  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  36.13 
 
 		 971 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  32.56 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.74 
 
 		 487 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.34 
 
 		 971 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.37 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  31.22 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  40.81 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  31.78 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  31 
 
 		 680 aa  103  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1108  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 342 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633913  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  35.45 
 
 		 961 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  36.46 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  32.95 
 
 		 2413 aa  100  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  32.78 
 
 		 208 aa  99.8  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  33.18 
 
 		 839 aa  98.6  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  36.11 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  31.8 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  28.77 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  33.48 
 
 		 325 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  30.43 
 
 		 380 aa  95.9  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 252 aa  95.5  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>