More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3268 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3567  Sel1 domain protein repeat-containing protein  91.94 
 
 
360 aa  669    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 
360 aa  721    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3674  enhanced entry protein  67.29 
 
 
540 aa  443  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2666  Sel1 domain-containing protein  67 
 
 
381 aa  425  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0163222  normal  0.379262 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  45.61 
 
 
337 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1708  hypothetical protein  48.97 
 
 
362 aa  270  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1651  hypothetical protein  48.97 
 
 
362 aa  271  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.563504  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  42.98 
 
 
350 aa  262  6.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3521  Sel1 domain-containing protein  37.43 
 
 
387 aa  170  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.894704  normal  0.280761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.33 
 
 
382 aa  157  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2648  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.45 
 
 
347 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0668923  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2371  Sel1 domain-containing protein  40.45 
 
 
372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.4 
 
 
363 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  36.69 
 
 
384 aa  152  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  33.82 
 
 
368 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0312  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.89 
 
 
322 aa  149  7e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  35.16 
 
 
367 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  33.77 
 
 
368 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  34.67 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  32.97 
 
 
357 aa  139  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.64 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00795685  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  39.53 
 
 
684 aa  134  3e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0154  Sel1 domain-containing protein  35.04 
 
 
350 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0876617 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  33.09 
 
 
346 aa  133  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  36.43 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  35.66 
 
 
789 aa  126  7e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  35.56 
 
 
557 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  34.65 
 
 
961 aa  123  5e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.08 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  32.34 
 
 
1037 aa  120  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  35.04 
 
 
393 aa  116  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  34.54 
 
 
1402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  34.07 
 
 
831 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0156  hypothetical protein  31.93 
 
 
365 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  33.96 
 
 
376 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  34.38 
 
 
489 aa  113  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  30.52 
 
 
685 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.19 
 
 
448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 
416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  32.21 
 
 
376 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 
1032 aa  110  5e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 
303 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  33.22 
 
 
490 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  33.22 
 
 
490 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  33.63 
 
 
1493 aa  106  7e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  35.57 
 
 
373 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  31.78 
 
 
305 aa  104  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.16 
 
 
380 aa  105  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  34.52 
 
 
255 aa  102  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 
976 aa  103  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  31.32 
 
 
838 aa  102  8e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  36.73 
 
 
235 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.74 
 
 
341 aa  100  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  31.28 
 
 
1430 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  32.13 
 
 
1877 aa  100  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  32.09 
 
 
839 aa  99.8  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  36.15 
 
 
276 aa  99.8  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.18 
 
 
346 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  34.54 
 
 
373 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  34.75 
 
 
380 aa  98.6  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.73 
 
 
528 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  36.26 
 
 
256 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  28.34 
 
 
329 aa  97.1  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.69 
 
 
593 aa  95.1  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  32.67 
 
 
2413 aa  95.1  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.49 
 
 
865 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  31.9 
 
 
961 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.77 
 
 
343 aa  92.8  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  30.7 
 
 
415 aa  92.8  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  29.61 
 
 
348 aa  92.8  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  33.18 
 
 
267 aa  92.4  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  30.18 
 
 
342 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  31.31 
 
 
425 aa  92  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  34.64 
 
 
232 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  31.47 
 
 
254 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  31.22 
 
 
246 aa  90.5  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  28.97 
 
 
271 aa  90.1  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.12 
 
 
270 aa  89.7  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  31.09 
 
 
380 aa  89.4  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 
464 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  27.95 
 
 
1002 aa  87.4  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  34.23 
 
 
344 aa  87  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  26.37 
 
 
399 aa  86.3  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  31.69 
 
 
358 aa  85.9  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  31.6 
 
 
264 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  30.52 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  33.18 
 
 
301 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.32 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.58 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  27.5 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  32.14 
 
 
680 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  29.46 
 
 
293 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  30.29 
 
 
505 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  28.52 
 
 
552 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.68 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.82 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  28.28 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  27.7 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  31.55 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  28.83 
 
 
850 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>