More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3183 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  100 
 
 
337 aa  670    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1708  hypothetical protein  54.04 
 
 
362 aa  288  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1651  hypothetical protein  54.04 
 
 
362 aa  288  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.563504  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  47.23 
 
 
350 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3268  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.61 
 
 
360 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2666  Sel1 domain-containing protein  47.81 
 
 
381 aa  272  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0163222  normal  0.379262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3567  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.58 
 
 
360 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3674  enhanced entry protein  50 
 
 
540 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0156  hypothetical protein  30.88 
 
 
365 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  40 
 
 
684 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2648  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.69 
 
 
347 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0668923  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2371  Sel1 domain-containing protein  36.12 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  35.71 
 
 
384 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0312  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.83 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.58 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  38.63 
 
 
489 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3521  Sel1 domain-containing protein  35.45 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.894704  normal  0.280761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.03 
 
 
382 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  33.02 
 
 
368 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  37.55 
 
 
831 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  34.44 
 
 
368 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.33 
 
 
318 aa  132  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  35.37 
 
 
685 aa  132  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.07 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  37.55 
 
 
1402 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  39.19 
 
 
490 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  39.19 
 
 
490 aa  130  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  30.46 
 
 
357 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  34.12 
 
 
376 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  34.76 
 
 
961 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  35.04 
 
 
789 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  34.44 
 
 
376 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  37.5 
 
 
557 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  33.59 
 
 
1037 aa  126  5e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  38.37 
 
 
416 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  36 
 
 
393 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  33.72 
 
 
346 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  37.39 
 
 
448 aa  122  7e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  33.21 
 
 
367 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  36.68 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0154  Sel1 domain-containing protein  34.05 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0876617 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  33.33 
 
 
838 aa  120  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  34.72 
 
 
321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.2 
 
 
343 aa  118  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  32.23 
 
 
366 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.17 
 
 
346 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  33.04 
 
 
305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 
1032 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.05 
 
 
319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00795685  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  34.32 
 
 
1493 aa  116  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.47 
 
 
528 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.77 
 
 
341 aa  113  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  35.09 
 
 
271 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  38.79 
 
 
399 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  31.76 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  33.17 
 
 
235 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  30.99 
 
 
329 aa  110  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  34.84 
 
 
1877 aa  110  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  31.22 
 
 
342 aa  109  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  31.33 
 
 
373 aa  108  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  36.67 
 
 
380 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  39.25 
 
 
255 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.2 
 
 
278 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  34.04 
 
 
425 aa  105  9e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  34.74 
 
 
256 aa  105  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  33.48 
 
 
679 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  33.92 
 
 
680 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  35.68 
 
 
267 aa  103  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  33.65 
 
 
1002 aa  103  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  29.45 
 
 
552 aa  102  7e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.47 
 
 
270 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  34.1 
 
 
2413 aa  102  9e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  34.07 
 
 
359 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  31.43 
 
 
264 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 
976 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  34.6 
 
 
245 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 
1430 aa  99  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  36.76 
 
 
274 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  31.78 
 
 
839 aa  99  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  35.68 
 
 
232 aa  96.3  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  34.21 
 
 
482 aa  95.5  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  35.08 
 
 
293 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  34.39 
 
 
358 aa  94.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  29.55 
 
 
523 aa  94  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  38.42 
 
 
246 aa  93.6  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  32.86 
 
 
464 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  36.78 
 
 
731 aa  92  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  28.81 
 
 
509 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.88 
 
 
316 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.78 
 
 
890 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  31.02 
 
 
303 aa  90.5  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  28.81 
 
 
509 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  28.35 
 
 
1200 aa  90.1  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.85 
 
 
593 aa  89.7  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  28.81 
 
 
509 aa  89.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.48 
 
 
1110 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.35 
 
 
811 aa  89  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  33.33 
 
 
839 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2868  Sel1 domain-containing protein  34.25 
 
 
245 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>