More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0307 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 
811 aa  1661    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  31.24 
 
 
1402 aa  287  5.999999999999999e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  34.64 
 
 
684 aa  250  7e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  34.36 
 
 
961 aa  237  6e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  34.64 
 
 
831 aa  221  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  34.66 
 
 
789 aa  205  3e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30.73 
 
 
1493 aa  195  3e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  36.81 
 
 
1037 aa  190  8e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  31.36 
 
 
557 aa  177  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  32.16 
 
 
490 aa  176  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 
1032 aa  173  9e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  31.94 
 
 
490 aa  173  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.55 
 
 
380 aa  165  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  31.71 
 
 
489 aa  162  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.65 
 
 
278 aa  162  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  28.95 
 
 
685 aa  160  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  32.99 
 
 
448 aa  158  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  31.88 
 
 
425 aa  155  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.75 
 
 
865 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  24.86 
 
 
1366 aa  154  8e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  34.59 
 
 
376 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  28.16 
 
 
1877 aa  152  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  34.25 
 
 
376 aa  150  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 
976 aa  147  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  33.13 
 
 
393 aa  141  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  31.86 
 
 
523 aa  137  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.77 
 
 
528 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.18 
 
 
318 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  32.44 
 
 
373 aa  128  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  28.19 
 
 
679 aa  127  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.24 
 
 
512 aa  127  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0434  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 
464 aa  127  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  32.14 
 
 
373 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  24.87 
 
 
680 aa  124  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.76 
 
 
341 aa  124  7e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  28.68 
 
 
509 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  29.32 
 
 
380 aa  122  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  28.93 
 
 
509 aa  121  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  28.93 
 
 
509 aa  121  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  28.93 
 
 
509 aa  120  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  23.18 
 
 
693 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  29.13 
 
 
1002 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  27.18 
 
 
1078 aa  119  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.79 
 
 
890 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  33.61 
 
 
416 aa  118  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  27.02 
 
 
1044 aa  117  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.06 
 
 
487 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  24.14 
 
 
961 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  32.91 
 
 
264 aa  116  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  28.13 
 
 
505 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  35.02 
 
 
2413 aa  115  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  28.97 
 
 
1430 aa  115  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  30.6 
 
 
464 aa  115  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  27.9 
 
 
1141 aa  114  6e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  29.75 
 
 
380 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  40.25 
 
 
235 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  27.89 
 
 
342 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  33.2 
 
 
838 aa  111  6e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  32.13 
 
 
267 aa  111  7.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  30.38 
 
 
305 aa  110  8.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.44 
 
 
346 aa  110  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  32.55 
 
 
552 aa  108  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.65 
 
 
343 aa  108  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  32.78 
 
 
331 aa  108  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.22 
 
 
272 aa  107  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  28.29 
 
 
403 aa  107  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  27.98 
 
 
1200 aa  106  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  28.42 
 
 
1200 aa  106  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  31.9 
 
 
365 aa  106  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.9 
 
 
321 aa  106  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  39.62 
 
 
252 aa  106  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  30.19 
 
 
358 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  32.27 
 
 
293 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.71 
 
 
363 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2792  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.35 
 
 
455 aa  104  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  32.43 
 
 
367 aa  104  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  26.46 
 
 
399 aa  103  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.43 
 
 
392 aa  103  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  31.73 
 
 
271 aa  103  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  41.61 
 
 
329 aa  102  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3240  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.1 
 
 
450 aa  101  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  34.44 
 
 
241 aa  100  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  33.21 
 
 
303 aa  100  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  29.96 
 
 
331 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  29.96 
 
 
331 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  37.91 
 
 
246 aa  100  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  32.9 
 
 
368 aa  99.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  29.96 
 
 
331 aa  99.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  32.41 
 
 
346 aa  99.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4473  Sel1-like protein  32.27 
 
 
366 aa  99  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  36.77 
 
 
223 aa  99  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  32.16 
 
 
245 aa  98.2  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  26.36 
 
 
327 aa  97.8  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1085  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.71 
 
 
450 aa  96.7  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  37.06 
 
 
208 aa  97.1  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  33.18 
 
 
256 aa  96.3  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  26.81 
 
 
348 aa  95.9  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  36.88 
 
 
731 aa  95.9  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  32.74 
 
 
368 aa  95.5  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.38 
 
 
321 aa  94  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>