More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2686 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  100 
 
 
961 aa  1900    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  33.2 
 
 
1402 aa  335  3e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  30.97 
 
 
961 aa  271  2.9999999999999997e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  35 
 
 
684 aa  267  7e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  31.9 
 
 
831 aa  247  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  32.92 
 
 
557 aa  232  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 
1032 aa  221  7e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  29.48 
 
 
1493 aa  221  7.999999999999999e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  34.19 
 
 
789 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  33.79 
 
 
490 aa  212  3e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  34.02 
 
 
490 aa  211  6e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  36.25 
 
 
489 aa  207  8e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 
976 aa  205  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  28.14 
 
 
685 aa  197  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  36.54 
 
 
393 aa  185  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.46 
 
 
865 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  31.1 
 
 
1037 aa  180  9e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  32.61 
 
 
425 aa  180  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  27.35 
 
 
1877 aa  176  1.9999999999999998e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  29.88 
 
 
680 aa  171  7e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  31.79 
 
 
448 aa  169  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.12 
 
 
341 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  30.98 
 
 
679 aa  165  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.5 
 
 
528 aa  161  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  38.04 
 
 
380 aa  159  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  33.49 
 
 
464 aa  158  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  34.64 
 
 
342 aa  156  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  33.33 
 
 
305 aa  154  8e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.7 
 
 
380 aa  154  8.999999999999999e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.44 
 
 
343 aa  147  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  28.77 
 
 
509 aa  147  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  29.23 
 
 
509 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  29.23 
 
 
509 aa  146  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  29.23 
 
 
509 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  38.85 
 
 
416 aa  143  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.66 
 
 
318 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  32.89 
 
 
376 aa  141  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.48 
 
 
487 aa  140  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  34.93 
 
 
505 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  32.23 
 
 
376 aa  138  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.85 
 
 
392 aa  138  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  32.69 
 
 
552 aa  138  6.0000000000000005e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  24.47 
 
 
693 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  36.7 
 
 
358 aa  136  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  30.12 
 
 
1430 aa  136  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  35.27 
 
 
256 aa  134  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  26.5 
 
 
1366 aa  134  7.999999999999999e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  30.46 
 
 
380 aa  132  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  37.11 
 
 
359 aa  131  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  32.48 
 
 
1002 aa  130  9.000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  27.31 
 
 
1200 aa  130  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  27.1 
 
 
1200 aa  129  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.68 
 
 
512 aa  129  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.02 
 
 
346 aa  127  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  30.19 
 
 
373 aa  127  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  40.82 
 
 
255 aa  126  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  28.17 
 
 
523 aa  125  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  30.19 
 
 
373 aa  124  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.88 
 
 
316 aa  124  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.11 
 
 
325 aa  123  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  31.11 
 
 
325 aa  123  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  31.79 
 
 
325 aa  122  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.07 
 
 
593 aa  121  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  23.55 
 
 
1044 aa  120  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  23.28 
 
 
1078 aa  120  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  30.9 
 
 
331 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  31.82 
 
 
329 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  36.07 
 
 
2413 aa  120  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  34.91 
 
 
838 aa  120  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  32.47 
 
 
293 aa  118  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 
303 aa  118  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  34.56 
 
 
271 aa  118  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  30.16 
 
 
327 aa  118  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.04 
 
 
890 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  33.97 
 
 
285 aa  117  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  30.77 
 
 
415 aa  117  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.28 
 
 
811 aa  116  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.03 
 
 
565 aa  117  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  36.55 
 
 
232 aa  116  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  30.23 
 
 
591 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  34.38 
 
 
267 aa  115  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0954  Sel1 domain-containing protein  33.09 
 
 
478 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.683818  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  26.89 
 
 
348 aa  115  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  30.03 
 
 
850 aa  115  5e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  32.4 
 
 
399 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  28.29 
 
 
331 aa  114  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  28.29 
 
 
331 aa  114  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.56 
 
 
382 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  40.91 
 
 
301 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  28.29 
 
 
331 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.23 
 
 
798 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.08 
 
 
278 aa  112  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  33.92 
 
 
403 aa  110  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  29.76 
 
 
264 aa  110  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  34.5 
 
 
245 aa  109  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  33.85 
 
 
235 aa  110  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  38.55 
 
 
208 aa  108  7e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.05 
 
 
321 aa  107  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  27.31 
 
 
536 aa  106  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  25.95 
 
 
1141 aa  105  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>