More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1617 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
798 aa  1559    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  59.55 
 
 
442 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  59.23 
 
 
397 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  37.1 
 
 
831 aa  246  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  38.24 
 
 
557 aa  222  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  33.57 
 
 
1402 aa  211  3e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.8 
 
 
684 aa  207  6e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.45 
 
 
499 aa  207  7e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  43.32 
 
 
500 aa  204  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.69 
 
 
502 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.22 
 
 
501 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  32.41 
 
 
1493 aa  201  3.9999999999999996e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.29 
 
 
497 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  36.66 
 
 
1032 aa  195  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  36.48 
 
 
489 aa  195  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  41.46 
 
 
482 aa  193  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  30.57 
 
 
961 aa  186  2.0000000000000003e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  37.79 
 
 
393 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  34.97 
 
 
425 aa  183  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  32.4 
 
 
789 aa  181  4e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  31.15 
 
 
685 aa  171  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  34.99 
 
 
464 aa  171  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  31.66 
 
 
490 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  31.66 
 
 
490 aa  169  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  28.1 
 
 
1037 aa  161  5e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  36.46 
 
 
505 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.76 
 
 
343 aa  154  5.9999999999999996e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  32.78 
 
 
976 aa  151  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.71 
 
 
528 aa  151  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  30.32 
 
 
985 aa  147  1e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  39.33 
 
 
380 aa  146  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  33.04 
 
 
486 aa  141  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.27 
 
 
341 aa  138  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  30.73 
 
 
448 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.43 
 
 
487 aa  136  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  37.4 
 
 
416 aa  134  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.85 
 
 
346 aa  134  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  33.89 
 
 
376 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.14 
 
 
380 aa  132  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  37.54 
 
 
359 aa  133  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.51 
 
 
392 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  26.92 
 
 
1877 aa  130  9.000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  33.56 
 
 
376 aa  130  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  33.58 
 
 
305 aa  130  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.32 
 
 
316 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3027  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.39 
 
 
697 aa  129  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.438464  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30 
 
 
865 aa  127  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  36.72 
 
 
303 aa  126  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.38 
 
 
971 aa  126  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  30.19 
 
 
477 aa  126  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  30.73 
 
 
380 aa  125  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  33.44 
 
 
552 aa  124  5e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.66 
 
 
321 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  28.23 
 
 
693 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  27.89 
 
 
971 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0721  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.65 
 
 
696 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  37.07 
 
 
271 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  35.93 
 
 
2413 aa  117  8.999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  29.95 
 
 
509 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  35.39 
 
 
358 aa  116  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  28.71 
 
 
342 aa  116  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.84 
 
 
282 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  29.95 
 
 
509 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  29.95 
 
 
509 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.05 
 
 
512 aa  115  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  29.95 
 
 
509 aa  115  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  31.33 
 
 
373 aa  113  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  34.35 
 
 
1002 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  36.32 
 
 
256 aa  112  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  26.96 
 
 
1366 aa  110  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  28.93 
 
 
523 aa  110  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  29.78 
 
 
705 aa  110  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  31.01 
 
 
373 aa  109  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  30.71 
 
 
680 aa  109  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  33.45 
 
 
482 aa  109  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.16 
 
 
1155 aa  109  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  31.78 
 
 
838 aa  108  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  28.35 
 
 
1200 aa  108  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.6 
 
 
1056 aa  107  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  28.35 
 
 
1200 aa  107  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.89 
 
 
445 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35 
 
 
839 aa  107  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 
252 aa  107  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  26.38 
 
 
331 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  29.87 
 
 
1281 aa  106  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  28.57 
 
 
536 aa  105  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  36.17 
 
 
232 aa  106  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  32.08 
 
 
961 aa  105  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.48 
 
 
318 aa  105  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.79 
 
 
784 aa  105  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  38.83 
 
 
255 aa  105  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.4 
 
 
988 aa  104  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  35.09 
 
 
267 aa  104  8e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  34.45 
 
 
839 aa  104  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  26.09 
 
 
331 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  26.09 
 
 
331 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  29.07 
 
 
850 aa  103  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  33.5 
 
 
235 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.66 
 
 
421 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  27.86 
 
 
1044 aa  103  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>