107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4354 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  73.6 
 
 
486 aa  699    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  100 
 
 
477 aa  966    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.04 
 
 
971 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  38.41 
 
 
971 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.19 
 
 
718 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.78 
 
 
713 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.75 
 
 
859 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.91 
 
 
445 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.98 
 
 
860 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.36 
 
 
778 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.81 
 
 
708 aa  180  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.27 
 
 
485 aa  179  9e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.19 
 
 
1155 aa  177  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  39.85 
 
 
449 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  37.78 
 
 
619 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.6 
 
 
839 aa  176  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.98 
 
 
728 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  43.32 
 
 
1022 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.78 
 
 
495 aa  172  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.25 
 
 
554 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  43.53 
 
 
1056 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.11 
 
 
502 aa  171  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.2 
 
 
481 aa  169  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  43.93 
 
 
784 aa  169  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.21 
 
 
479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  43.64 
 
 
988 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.69 
 
 
680 aa  167  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.26 
 
 
1056 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40 
 
 
472 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  43.22 
 
 
818 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.68 
 
 
421 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.14 
 
 
489 aa  158  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  36.99 
 
 
500 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  35 
 
 
576 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.17 
 
 
478 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.54 
 
 
629 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.74 
 
 
485 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.49 
 
 
515 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.47 
 
 
649 aa  154  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.74 
 
 
490 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  38.33 
 
 
499 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  35.25 
 
 
276 aa  152  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.59 
 
 
499 aa  152  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.44 
 
 
486 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.69 
 
 
501 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
657 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  31.51 
 
 
654 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.91 
 
 
502 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.3 
 
 
442 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  34.64 
 
 
482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.09 
 
 
766 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3731  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.47 
 
 
652 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.016109  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  32.6 
 
 
616 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.58 
 
 
397 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.71 
 
 
497 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4521  caspase-like domain-containing protein  29.6 
 
 
798 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3182  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.49 
 
 
1026 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740099  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.77 
 
 
798 aa  114  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  33.45 
 
 
472 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  30.83 
 
 
527 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0960  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.07 
 
 
862 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.355322  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.22 
 
 
824 aa  108  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 
528 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0752  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.82 
 
 
479 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.28 
 
 
915 aa  106  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30 
 
 
504 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.52 
 
 
291 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.02 
 
 
291 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5502  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.33 
 
 
813 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.38 
 
 
541 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  29.61 
 
 
535 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.4 
 
 
474 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0290  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.99 
 
 
776 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106858  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.24 
 
 
522 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.71 
 
 
295 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.71 
 
 
828 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  27.86 
 
 
570 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  28.74 
 
 
518 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3106  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.55 
 
 
159 aa  90.1  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 
292 aa  89.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.93 
 
 
511 aa  87.4  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.57 
 
 
288 aa  87.4  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.97 
 
 
553 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.89 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1734  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.74 
 
 
570 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.055042 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  27.19 
 
 
523 aa  78.2  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  26.61 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3999  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.81 
 
 
568 aa  65.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.121283  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4743  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.86 
 
 
573 aa  58.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258371  normal  0.341295 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4612  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.17 
 
 
244 aa  55.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  44.83 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  56.25 
 
 
312 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.78 
 
 
652 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530037  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.16 
 
 
477 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  26.13 
 
 
781 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2313  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.51 
 
 
596 aa  49.7  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0031  TIR protein  31.51 
 
 
544 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  22.51 
 
 
925 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1062  hypothetical protein  51.16 
 
 
262 aa  47  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71231  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1470  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.32 
 
 
753 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>