More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3027 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0721  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  89.16 
 
 		 696 aa  1167    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3027  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 697 aa  1404    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.438464  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4784  peptidase C14 caspase catalytic subunit P20  77.32 
 
 		 146 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.07 
 
 		 798 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.98 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.83 
 
 		 428 aa  112  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  33.46 
 
 		 442 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.04 
 
 		 860 aa  92.8  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  34.19 
 
 		 831 aa  89.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2511  Sel1-like protein  37.25 
 
 		 287 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  33.73 
 
 		 1402 aa  88.2  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  35.25 
 
 		 557 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 		 1032 aa  85.5  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  36.09 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  35.51 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  35.51 
 
 		 490 aa  84.3  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  28.89 
 
 		 684 aa  80.9  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.46 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.57 
 
 		 859 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2358  Sel1  33.33 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1493 aa  78.6  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3437  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.29 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  32.53 
 
 		 1200 aa  77  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  32.53 
 
 		 1200 aa  77  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.39 
 
 		 380 aa  77  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  30.72 
 
 		 185 aa  77  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2933  tetratricopeptide TPR_2  31.28 
 
 		 287 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  33.09 
 
 		 961 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.07 
 
 		 565 aa  76.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.62 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  28.92 
 
 		 971 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  34.19 
 
 		 393 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  34.39 
 
 		 1002 aa  73.9  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  31.58 
 
 		 209 aa  73.2  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  35.47 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  31.74 
 
 		 976 aa  72.8  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  29.76 
 
 		 376 aa  72  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  29.76 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.92 
 
 		 971 aa  71.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  31.61 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  34.33 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  40.18 
 
 		 1430 aa  72  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  30.57 
 
 		 789 aa  71.6  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  35.81 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  32.26 
 
 		 685 aa  71.2  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.24 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.57 
 
 		 231 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  36.69 
 
 		 489 aa  70.5  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2828  Sel1-like  28.87 
 
 		 531 aa  70.5  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0495892  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.88 
 
 		 328 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  32.64 
 
 		 329 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  42.71 
 
 		 117 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.67 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  32.14 
 
 		 505 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1037 aa  68.2  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.37 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  29.56 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  26.32 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  29.75 
 
 		 693 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  31.37 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.82 
 
 		 321 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  30.88 
 
 		 305 aa  66.6  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  29.94 
 
 		 232 aa  67  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  33.77 
 
 		 315 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  26.56 
 
 		 448 aa  66.6  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  34.78 
 
 		 365 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  29.96 
 
 		 900 aa  66.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  31.91 
 
 		 331 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  37.31 
 
 		 358 aa  66.2  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1606  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.69 
 
 		 222 aa  65.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.566545  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  28.97 
 
 		 235 aa  65.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  28.57 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.22 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1876  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  34.33 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0146933  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0106  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  30.68 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.99 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4191  Sel1 domain-containing protein  36.07 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  25.68 
 
 		 636 aa  64.7  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0589  Sel1 repeat-containing protein  29.66 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  31.47 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  28.49 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  28.57 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4713  Sel1 domain-containing protein  35.25 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.767637 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  30.3 
 
 		 202 aa  63.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1929  Sel1 repeat-containing protein  34.04 
 
 		 228 aa  63.9  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  39.13 
 
 		 221 aa  63.9  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  28.95 
 
 		 327 aa  63.5  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  25.77 
 
 		 254 aa  63.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  31.21 
 
 		 208 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.95 
 
 		 865 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  35.11 
 
 		 731 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  33.04 
 
 		 839 aa  62.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  29.46 
 
 		 903 aa  62.4  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.08 
 
 		 316 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2501  Sel1 repeat-containing protein  30 
 
 		 250 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.8 
 
 		 649 aa  62.4  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.22 
 
 		 1012 aa  63.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>