More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2511 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2511  Sel1-like protein  100 
 
 		 287 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2933  tetratricopeptide TPR_2  84.03 
 
 		 287 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3437  Sel1 domain protein repeat-containing protein  81.03 
 
 		 278 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2358  Sel1  74.19 
 
 		 283 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.74 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  38.61 
 
 		 1402 aa  107  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  38.97 
 
 		 961 aa  106  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  35.78 
 
 		 831 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  37.76 
 
 		 684 aa  100  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  35.85 
 
 		 789 aa  98.2  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  40.11 
 
 		 373 aa  95.9  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  34.33 
 
 		 557 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  39.55 
 
 		 373 aa  93.2  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  35.71 
 
 		 489 aa  93.2  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1032 aa  92.4  9e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.75 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38 
 
 		 798 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 376 aa  90.5  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  34.74 
 
 		 376 aa  89.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  33.5 
 
 		 1493 aa  89.7  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  34.83 
 
 		 685 aa  89.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3027  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.25 
 
 		 697 aa  89  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.438464  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  36.9 
 
 		 221 aa  87.8  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.86 
 
 		 343 aa  87  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  38.33 
 
 		 416 aa  87.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  32.27 
 
 		 464 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  39.22 
 
 		 505 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  38.73 
 
 		 2413 aa  86.3  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.27 
 
 		 341 aa  85.9  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.03 
 
 		 865 aa  85.5  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  33.85 
 
 		 490 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  33.33 
 
 		 490 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.1 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  34.12 
 
 		 1877 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  33.05 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.79 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 		 358 aa  82.4  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  34.29 
 
 		 235 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0721  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.14 
 
 		 696 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  30.57 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  31.27 
 
 		 971 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  34.62 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.64 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  30.33 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.27 
 
 		 971 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1002 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  35.93 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.07 
 
 		 380 aa  79  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.13 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  36.54 
 
 		 232 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.93 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  33.33 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  31.47 
 
 		 1037 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.02 
 
 		 890 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.89 
 
 		 487 aa  75.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  31.95 
 
 		 838 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  30.26 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.12 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  30.26 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  31.28 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.1 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00795685  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  31.32 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0462  Sel1 domain-containing protein  32.61 
 
 		 511 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.781261  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  33.5 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.52 
 
 		 565 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  31.16 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  30.63 
 
 		 523 aa  73.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.9 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0483  Sel1 domain-containing protein  32.61 
 
 		 511 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0431486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  32.5 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  33 
 
 		 482 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.23 
 
 		 528 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.56 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  31.53 
 
 		 1044 aa  72.8  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  31.53 
 
 		 1078 aa  72.4  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  35.48 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1929  Sel1 repeat-containing protein  30 
 
 		 228 aa  72  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  31.12 
 
 		 552 aa  72  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.2 
 
 		 363 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 976 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  32.75 
 
 		 731 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  29 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2732  Sel1  32.5 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000135758  unclonable  0.000000152447 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  36.48 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  30.47 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  35.11 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3857  Sel1 domain-containing protein  31.52 
 
 		 511 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.277473  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  34.34 
 
 		 1200 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  34.34 
 
 		 1200 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  27.86 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0486  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.07 
 
 		 511 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.01 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  32.2 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  39.27 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.66 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  33.66 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>